64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0274 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0274  Excalibur domain protein  100 
 
 
443 aa  863    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.611363  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0753  nuclease  41.38 
 
 
237 aa  85.5  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.838035  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1341  nuclease (SNase domain protein)  41.27 
 
 
271 aa  79.3  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.223732  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0060  nuclease  34.55 
 
 
351 aa  71.2  0.00000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0794  nuclease  40.18 
 
 
327 aa  70.5  0.00000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0199  nuclease  47.37 
 
 
374 aa  70.1  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.565023  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0374  nuclease  49.44 
 
 
346 aa  70.1  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.180384  hitchhiker  0.00530121 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2387  Excalibur domain protein  62.5 
 
 
233 aa  64.3  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000276627  hitchhiker  0.000344764 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0371  nuclease  40.86 
 
 
350 aa  60.1  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000121604  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0844  nuclease  35.24 
 
 
218 aa  57.8  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2262  nuclease (SNase-like)  36.89 
 
 
324 aa  57.4  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.274888  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0018  nuclease (SNase domain protein)  37.93 
 
 
372 aa  57  0.0000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00664076  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1912  nuclease (SNase-like)  36.07 
 
 
323 aa  56.6  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183465  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15970  micrococcal nuclease-like nuclease  42.67 
 
 
388 aa  55.1  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.339667  normal  0.0582928 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0133  nuclease  28.5 
 
 
231 aa  55.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.247387 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0594  Excalibur domain-containing protein  28.92 
 
 
211 aa  54.3  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.187659 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1214  putative CheA signal transduction histidine kinase  52.63 
 
 
349 aa  53.9  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0608  nuclease  34.26 
 
 
214 aa  52.8  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.780099  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1900  nuclease (SNase-like)  37.04 
 
 
266 aa  51.2  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.898699  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2736  Micrococcal nuclease  40.48 
 
 
258 aa  51.6  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5232  nuclease (SNase domain protein)  39.33 
 
 
175 aa  51.2  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6539  Excalibur domain-containing protein  42.62 
 
 
211 aa  50.8  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.199317 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1952  hypothetical protein  47.5 
 
 
287 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.571007  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  30.88 
 
 
212 aa  50.4  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2149  hypothetical protein  50 
 
 
333 aa  50.1  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2000  hypothetical protein  50 
 
 
333 aa  50.1  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2215  hypothetical protein  50 
 
 
332 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2180  hypothetical protein  50 
 
 
318 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1973  hypothetical protein  50 
 
 
303 aa  49.7  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000663025  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2154  excalibur domain family  50 
 
 
287 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2296  hypothetical protein  50 
 
 
331 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.396677  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0844  Excalibur domain protein  45.65 
 
 
115 aa  48.1  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04500  nuclease (SNase domain protein)  30.25 
 
 
276 aa  48.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0301  Excalibur domain protein  45.45 
 
 
154 aa  47.4  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4124  nuclease  35.44 
 
 
260 aa  47  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000792946  hitchhiker  0.000000518116 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3801  Excalibur domain protein  43.18 
 
 
219 aa  46.6  0.0009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.533693  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0504  Excalibur  47.73 
 
 
138 aa  46.6  0.0009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1992  Excalibur domain-containing protein  47.22 
 
 
334 aa  46.6  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00268093  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5183  Excalibur domain protein  52.78 
 
 
156 aa  46.2  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1118  nuclease (SNase domain protein)  26.25 
 
 
180 aa  46.2  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  28.71 
 
 
178 aa  46.2  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000025104  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  38.98 
 
 
175 aa  45.4  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4287  Domain of unknown function DUF1994  48.28 
 
 
303 aa  45.8  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.671447  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  38.98 
 
 
175 aa  45.4  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0400  nuclease  33.33 
 
 
267 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.246467  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0889  nuclease  27.19 
 
 
197 aa  45.4  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000805707  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0723  hypothetical protein  51.35 
 
 
142 aa  45.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0134  Excalibur  44.83 
 
 
220 aa  45.1  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.194412  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  38.98 
 
 
175 aa  45.4  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1385  thermonuclease  30.11 
 
 
190 aa  45.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000128794  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1412  thermonuclease  30.11 
 
 
190 aa  45.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000099778  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3160  hypothetical protein  44.74 
 
 
330 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0554413 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3573  baseplate hub protein, putative  30.69 
 
 
2379 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  50 
 
 
166 aa  44.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5135  staphylococcal nuclease-like protein  34.09 
 
 
247 aa  44.3  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2030  nuclease  33.86 
 
 
238 aa  44.3  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.000000000391548 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  44.59 
 
 
214 aa  43.9  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2046  nuclease (SNase-like)  33.02 
 
 
233 aa  43.9  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.484882 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2051  nuclease (SNase-like)  39.33 
 
 
228 aa  43.9  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0268547  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3634  nuclease (SNase domain protein)  36.73 
 
 
382 aa  43.9  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.322659 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0389  nuclease  24.49 
 
 
183 aa  43.9  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0912  Micrococcal nuclease (thermonuclease)  39.76 
 
 
190 aa  43.5  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3931  Excalibur domain protein  50 
 
 
77 aa  43.1  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02630  protein of unknown function (DUF1994)  44.44 
 
 
389 aa  43.1  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.91242  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>