105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0379 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_0379  nuclease  100 
 
 		 273 aa  541  1e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5136  nuclease  82.35 
 
 		 273 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4959  nuclease  80.88 
 
 		 273 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5086  nuclease (SNase domain protein)  80.31 
 
 		 255 aa  418  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.715814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0402  nuclease (SNase-like)  61.09 
 
 		 260 aa  331  8e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0400  nuclease  60.84 
 
 		 267 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.246467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0538  nuclease  60.54 
 
 		 266 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5135  staphylococcal nuclease-like protein  58.37 
 
 		 247 aa  289  3e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66700  putative nuclease  54.9 
 
 		 255 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5785  putative nuclease  54.76 
 
 		 255 aa  268  5e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.397198  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2093  nuclease (SNase domain protein)  35.06 
 
 		 278 aa  150  2e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00243596  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4124  nuclease  36.84 
 
 		 260 aa  138  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000792946  hitchhiker  0.000000518116 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2968  nuclease (SNase domain protein)  34.65 
 
 		 272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00021469  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2838  nuclease  30.04 
 
 		 247 aa  105  8e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.426487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0537  nuclease  31.97 
 
 		 286 aa  99.4  5e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0124  nuclease (SNase-like)  26.36 
 
 		 275 aa  86.3  5e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00271835  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04500  nuclease (SNase domain protein)  37.5 
 
 		 276 aa  86.3  5e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0382  nuclease  26.86 
 
 		 256 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3427  nuclease  30.52 
 
 		 263 aa  75.1  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.983203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3775  nuclease  32.22 
 
 		 257 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.770263  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1900  nuclease (SNase-like)  34.69 
 
 		 266 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.898699  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1118  nuclease (SNase domain protein)  34.27 
 
 		 180 aa  70.1  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1691  nuclease  27.9 
 
 		 272 aa  69.3  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0880921 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2044  nuclease (SNase-like)  35.22 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  30.97 
 
 		 166 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3457  nuclease  34.06 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000805339 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  30.23 
 
 		 178 aa  64.3  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000025104  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0753  nuclease  33.33 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.838035  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1218  micrococcal nuclease  29.21 
 
 		 284 aa  62.8  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340298  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5232  nuclease (SNase domain protein)  39.53 
 
 		 175 aa  62.4  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1599  nuclease  35 
 
 		 195 aa  62  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.798842  normal  0.295978 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0480  nuclease  40.31 
 
 		 136 aa  62  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.898976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1341  nuclease (SNase domain protein)  35.17 
 
 		 271 aa  61.6  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.223732  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  38.36 
 
 		 169 aa  60.8  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0912  Micrococcal nuclease (thermonuclease)  33.83 
 
 		 190 aa  60.8  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1889  nuclease (SNase domain protein)  31.11 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.058729  normal  0.0179002 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0889  nuclease  29.58 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000805707  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1084  nuclease (SNase domain protein)  35.24 
 
 		 333 aa  59.3  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.598507  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2051  nuclease (SNase-like)  36.22 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0268547  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2456  nuclease (SNase domain protein)  33.33 
 
 		 240 aa  58.2  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.127297  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0794  nuclease  32.34 
 
 		 327 aa  56.6  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1385  thermonuclease  29.46 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000128794  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1412  thermonuclease  29.46 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000099778  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  35.51 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0453  nuclease  27.82 
 
 		 259 aa  54.3  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.686842 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0982  nuclease (SNase-like)  28.31 
 
 		 249 aa  54.3  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000000101814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf871  nuclease, lipoprotein  26.28 
 
 		 234 aa  54.7  0.000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0103  thermonuclease  32.31 
 
 		 209 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.244407  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0276  nuclease (SNase-like)  29.39 
 
 		 264 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.1811 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0454  nuclease (SNase domain protein)  32.09 
 
 		 192 aa  53.1  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2776  nuclease (SNase-like)  30.77 
 
 		 186 aa  53.1  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00761  hypothetical protein  31.34 
 
 		 155 aa  52.8  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.489486 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0755  nuclease (SNase-like)  31.33 
 
 		 166 aa  52.8  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0060  nuclease  29.2 
 
 		 351 aa  52.8  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1250  nuclease (SNase-like)  41.24 
 
 		 124 aa  51.6  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1467  Excalibur domain-containing protein  22.91 
 
 		 259 aa  52  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  30.53 
 
 		 171 aa  51.6  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0133  nuclease  28.35 
 
 		 231 aa  51.6  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.247387 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2262  nuclease (SNase-like)  35.66 
 
 		 324 aa  50.8  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.274888  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0018  nuclease (SNase domain protein)  32.58 
 
 		 372 aa  51.6  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00664076  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  33.97 
 
 		 187 aa  50.4  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4496  nuclease  30.92 
 
 		 187 aa  50.8  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3090  nuclease (SNase-like)  40 
 
 		 201 aa  50.1  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.906098  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1722  nuclease (SNase domain protein)  31.11 
 
 		 273 aa  50.1  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1912  nuclease (SNase-like)  40.95 
 
 		 323 aa  49.3  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183465  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1176  nuclease  34.74 
 
 		 282 aa  49.3  0.00006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0509  nuclease (SNase-like)  28.18 
 
 		 273 aa  49.3  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.58824  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  28.57 
 
 		 185 aa  48.1  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0487  nuclease (SNase domain protein)  30.36 
 
 		 262 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.936462  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4927  nuclease (SNase domain protein)  33.54 
 
 		 200 aa  48.5  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1371  nuclease  31.58 
 
 		 231 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.490456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03631  hypothetical protein  28.57 
 
 		 155 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  32.81 
 
 		 161 aa  48.1  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1456  nuclease (SNase domain protein)  31.25 
 
 		 184 aa  47.8  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  30.47 
 
 		 174 aa  48.1  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4764  nuclease  40.43 
 
 		 196 aa  47  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00156339  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0844  nuclease  29.27 
 
 		 218 aa  47.4  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0848  nuclease-like protein  28.91 
 
 		 184 aa  46.6  0.0005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0898613  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2244  nuclease  31.43 
 
 		 534 aa  45.8  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000544674  normal  0.0168792 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4945  nuclease  39.58 
 
 		 170 aa  45.8  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.377656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  31.29 
 
 		 226 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2526  SNase-like nuclease  30.66 
 
 		 171 aa  45.4  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0971838  normal  0.0202736 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2298  nuclease  28.93 
 
 		 309 aa  45.4  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.195217  normal  0.652893 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7541  hypothetical protein  24.4 
 
 		 240 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0371  nuclease  28.65 
 
 		 350 aa  45.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000121604  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0199  nuclease  28.48 
 
 		 374 aa  45.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.565023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  26.92 
 
 		 153 aa  45.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  27.69 
 
 		 153 aa  45.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  32.39 
 
 		 158 aa  45.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0569  nuclease  27.89 
 
 		 192 aa  44.3  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  29.79 
 
 		 238 aa  44.3  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0612  hypothetical protein  26.53 
 
 		 176 aa  43.9  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  26.61 
 
 		 244 aa  43.9  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45339  predicted protein  31.31 
 
 		 334 aa  43.9  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0658  nuclease (SNase domain protein)  28.71 
 
 		 171 aa  43.9  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688137  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2736  Micrococcal nuclease  31.34 
 
 		 258 aa  43.9  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  35.14 
 
 		 162 aa  43.5  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  30.06 
 
 		 214 aa  43.5  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06071  micrococcal nuclease  29.47 
 
 		 185 aa  43.5  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.312315  normal  0.542138 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5373  putative nuclease-like protein  34.09 
 
 		 176 aa  43.1  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199446 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>