141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0859 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0859  nuclease (SNase domain protein)  100 
 
 		 243 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4628  SNase-like nuclease  80 
 
 		 242 aa  384  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0782  nuclease (SNase-like)  78.67 
 
 		 242 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4688  nuclease (SNase-like)  69.79 
 
 		 241 aa  361  7.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0545  putative nuclease-like protein  73.18 
 
 		 241 aa  347  1e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0379373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2576  nuclease (SNase domain protein)  51.36 
 
 		 358 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.901293  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0317  nuclease (SNase domain protein)  40.52 
 
 		 227 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183306  normal  0.136686 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0111  nuclease  40.52 
 
 		 227 aa  152  4e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0065  nuclease  39.29 
 
 		 227 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  36.36 
 
 		 214 aa  121  9e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  35.62 
 
 		 214 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5043  nuclease (SNase domain protein)  35.14 
 
 		 249 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2752  hypothetical protein  35.87 
 
 		 263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6820  nuclease (SNase domain protein)  31.12 
 
 		 226 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0330594  normal  0.398913 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  35.16 
 
 		 226 aa  112  5e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1554  nuclease (SNase-like)  42.68 
 
 		 202 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3956  nuclease (SNase-like)  40.94 
 
 		 171 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  38.96 
 
 		 212 aa  109  5e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1032  SNase-like nuclease  36.33 
 
 		 246 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0424  nuclease (SNase-like)  34.4 
 
 		 250 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.445506  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0594  Excalibur domain-containing protein  35.88 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.187659 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2244  nuclease  41.79 
 
 		 534 aa  106  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000544674  normal  0.0168792 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3744  nuclease  42.96 
 
 		 161 aa  103  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1131  nuclease (SNase-like)  33.79 
 
 		 246 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.844533  normal  0.680053 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0134  Excalibur  34.38 
 
 		 220 aa  102  6e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.194412  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1969  nuclease (SNase-like)  38.41 
 
 		 172 aa  101  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5017  nuclease  41.89 
 
 		 167 aa  98.6  8e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.177044 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1591  nuclease (SNase-like)  36.36 
 
 		 158 aa  97.8  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2471  nuclease (SNase domain protein)  38.46 
 
 		 177 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2193  nuclease  38.46 
 
 		 177 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2156  nuclease (SNase domain protein)  36.84 
 
 		 177 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0870  nuclease domain-containing protein  38.36 
 
 		 189 aa  95.5  7e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0862  nuclease domain-containing protein  38.36 
 
 		 189 aa  95.5  7e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4597  nuclease (SNase domain protein)  40.46 
 
 		 208 aa  95.5  7e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0232149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4153  nuclease (SNase domain protein)  39.46 
 
 		 166 aa  95.1  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.574783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5373  putative nuclease-like protein  42.11 
 
 		 176 aa  94.4  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199446 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1599  nuclease  34.1 
 
 		 195 aa  93.2  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.798842  normal  0.295978 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2357  nuclease  35.57 
 
 		 221 aa  93.2  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0848  nuclease-like protein  35.61 
 
 		 184 aa  88.6  9e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0898613  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4484  nuclease (SNase domain protein)  40.31 
 
 		 211 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.270396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4116  nuclease  41.09 
 
 		 209 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.373469  normal  0.63366 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9903  succinoglycan biosynthesis protein  34.36 
 
 		 168 aa  83.2  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2315  nuclease (SNase domain protein)  37.09 
 
 		 185 aa  79.3  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3323  nuclease  37.01 
 
 		 163 aa  78.6  0.00000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.763522 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2052  succinoglycan biosynthesis protein  35.56 
 
 		 171 aa  77.4  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132309  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  35.33 
 
 		 148 aa  77.4  0.0000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1730  nuclease  36.18 
 
 		 175 aa  75.1  0.0000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0510494  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2100  nuclease (SNase-like)  39.26 
 
 		 192 aa  73.2  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  30.46 
 
 		 175 aa  72.8  0.000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  30.46 
 
 		 175 aa  71.2  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3848  nuclease  38.79 
 
 		 186 aa  71.2  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  29.8 
 
 		 175 aa  70.9  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15970  micrococcal nuclease-like nuclease  27.2 
 
 		 388 aa  68.2  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.339667  normal  0.0582928 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  31.84 
 
 		 179 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  37.72 
 
 		 174 aa  67  0.0000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  32.26 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  31.69 
 
 		 192 aa  67  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  32.73 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  32.74 
 
 		 180 aa  63.9  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0217  hypothetical protein  34.48 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530241  normal  0.176582 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0742  putative lipoprotein  35.24 
 
 		 319 aa  62.4  0.000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  34 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  31.65 
 
 		 153 aa  62  0.000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  31.9 
 
 		 171 aa  60.5  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  35 
 
 		 162 aa  60.1  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  30.72 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2078  nuclease (SNase domain protein)  37.67 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  33.81 
 
 		 169 aa  60.1  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1464  micrococcal nuclease  35.14 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0188  hypothetical protein  31.03 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0791  hypothetical protein  34.29 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0394  hypothetical protein  55.77 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2942  prophage MuMc02, nuclease, putative  32.24 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1306  nuclease (SNase-like)  34.16 
 
 		 175 aa  58.9  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  30.77 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4452  hypothetical protein  35.71 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  30.2 
 
 		 187 aa  58.5  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25810  nuclease  37.19 
 
 		 169 aa  57.8  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.823432  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4029  hypothetical protein  31.68 
 
 		 329 aa  58.2  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1199  nuclease, putative  32.93 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000552466  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  32.52 
 
 		 156 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  33.11 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  31.95 
 
 		 166 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0138  hypothetical protein  31.13 
 
 		 281 aa  57.4  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.412267 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1886  nuclease  31.5 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0247855 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  30.65 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0873  nuclease (SNase-like)  32.14 
 
 		 178 aa  57  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  31.03 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03631  hypothetical protein  30.19 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  24.38 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0480  nuclease  34.75 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.898976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  25 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1190  nuclease  32.08 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0870678  normal  0.0174729 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1593  nuclease-like protein  30.99 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2340  nuclease (SNase domain protein)  29.38 
 
 		 162 aa  53.9  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  27.47 
 
 		 232 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3683  nuclease  33.55 
 
 		 153 aa  53.9  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0779  nuclease (SNase domain protein)  29.24 
 
 		 169 aa  53.5  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1898  hypothetical protein  54.72 
 
 		 214 aa  53.1  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0131013  normal  0.0107915 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2364  nuclease (SNase domain protein)  32.89 
 
 		 171 aa  52.8  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000986149  hitchhiker  0.0000256205 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>