33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9827 on replicon NC_011986
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011986  Avi_9827  Micrococcal nuclease (thermonuclease)  100 
 
 		 234 aa  482  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4568  nuclease  63.83 
 
 		 229 aa  299  3e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.313094  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6411  nuclease  66.37 
 
 		 233 aa  293  2e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4183  nuclease (SNase-like)  51.3 
 
 		 231 aa  228  8e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283514  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3744  nuclease  29.3 
 
 		 161 aa  61.6  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9903  succinoglycan biosynthesis protein  27.43 
 
 		 168 aa  59.7  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4628  SNase-like nuclease  31.97 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2052  succinoglycan biosynthesis protein  26.32 
 
 		 171 aa  54.7  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132309  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  28.97 
 
 		 212 aa  53.1  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0065  nuclease  28.14 
 
 		 227 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0317  nuclease (SNase domain protein)  28.57 
 
 		 227 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183306  normal  0.136686 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2357  nuclease  27.75 
 
 		 221 aa  52  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0782  nuclease (SNase-like)  28.97 
 
 		 242 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2576  nuclease (SNase domain protein)  28.12 
 
 		 358 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.901293  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0111  nuclease  27.92 
 
 		 227 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2526  SNase-like nuclease  29.21 
 
 		 171 aa  50.4  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0971838  normal  0.0202736 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0848  nuclease-like protein  24.84 
 
 		 184 aa  50.1  0.00003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0898613  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2100  nuclease (SNase-like)  31.51 
 
 		 192 aa  50.1  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3956  nuclease (SNase-like)  28.57 
 
 		 171 aa  50.1  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4597  nuclease (SNase domain protein)  29.94 
 
 		 208 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0232149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1969  nuclease (SNase-like)  29.08 
 
 		 172 aa  48.9  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1599  nuclease  27.22 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.798842  normal  0.295978 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1591  nuclease (SNase-like)  28.86 
 
 		 158 aa  48.1  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0594  Excalibur domain-containing protein  28.89 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.187659 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3848  nuclease  30.61 
 
 		 186 aa  47  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2244  nuclease  30.3 
 
 		 534 aa  46.2  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000544674  normal  0.0168792 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4688  nuclease (SNase-like)  26.4 
 
 		 241 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  30.37 
 
 		 214 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4452  hypothetical protein  32.03 
 
 		 194 aa  43.9  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1554  nuclease (SNase-like)  25.52 
 
 		 202 aa  43.5  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0859  nuclease (SNase domain protein)  28.97 
 
 		 243 aa  42.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2501  nuclease  29.22 
 
 		 205 aa  42  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.080015  normal  0.0413796 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  31.58 
 
 		 226 aa  41.6  0.01  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>