22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0394 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0394  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  387  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6820  nuclease (SNase domain protein)  46.21 
 
 		 226 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0330594  normal  0.398913 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1898  hypothetical protein  69.81 
 
 		 214 aa  78.2  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0131013  normal  0.0107915 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0317  nuclease (SNase domain protein)  64.15 
 
 		 227 aa  71.6  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183306  normal  0.136686 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0111  nuclease  46.59 
 
 		 227 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15970  micrococcal nuclease-like nuclease  54.72 
 
 		 388 aa  69.7  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.339667  normal  0.0582928 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0065  nuclease  46.51 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5111  hypothetical protein  47.76 
 
 		 89 aa  62.4  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0927764  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2313  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  53.85 
 
 		 406 aa  59.7  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0859  nuclease (SNase domain protein)  55.77 
 
 		 243 aa  58.9  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0545  putative nuclease-like protein  51.92 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0379373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4688  nuclease (SNase-like)  50 
 
 		 241 aa  55.1  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4628  SNase-like nuclease  51.92 
 
 		 242 aa  54.7  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0782  nuclease (SNase-like)  50 
 
 		 242 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180998  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6887  hypothetical protein  54.76 
 
 		 110 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  51.92 
 
 		 214 aa  48.5  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2574  beta-lactamase domain-containing protein  48.98 
 
 		 352 aa  48.1  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000152958  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  50 
 
 		 214 aa  47.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2576  nuclease (SNase domain protein)  43.08 
 
 		 358 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.901293  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  50 
 
 		 226 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1032  SNase-like nuclease  40.68 
 
 		 246 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03290  hypothetical protein  45.28 
 
 		 385 aa  42.4  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>