12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_03290 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_03290  hypothetical protein  100 
 
 		 385 aa  727    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10919  hypothetical protein  39.26 
 
 		 175 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.743867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2542  hypothetical protein  57.35 
 
 		 365 aa  79.3  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.276311  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23800  50S ribosomal protein L4  64.91 
 
 		 312 aa  75.1  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4621  ribosomal protein S16  58.18 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000355382  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2281  hypothetical protein  46.81 
 
 		 406 aa  47  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000928814 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16890  LSU ribosomal protein L17P  51.06 
 
 		 242 aa  45.1  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20580  LSU ribosomal protein L17P  52.38 
 
 		 268 aa  45.1  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.69658 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3381  ribosomal protein L17  55.81 
 
 		 233 aa  44.3  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0394  hypothetical protein  44.26 
 
 		 199 aa  43.5  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6820  nuclease (SNase domain protein)  37.93 
 
 		 226 aa  43.1  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0330594  normal  0.398913 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6666  hypothetical protein  33.33 
 
 		 868 aa  42.7  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0497533  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>