More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3381 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3381  ribosomal protein L17  100 
 
 		 233 aa  471  1e-132  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3668  ribosomal protein L17  74.5 
 
 		 203 aa  224  6e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1143  50S ribosomal protein L17  65.27 
 
 		 195 aa  212  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.25464 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1114  50S ribosomal protein L17  65.27 
 
 		 195 aa  212  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1131  50S ribosomal protein L17  65.27 
 
 		 195 aa  212  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20580  LSU ribosomal protein L17P  47.73 
 
 		 268 aa  211  7e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.69658 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1437  50S ribosomal protein L17  75.81 
 
 		 202 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.831815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13493  50S ribosomal protein L17  67.07 
 
 		 180 aa  194  1e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00579097  normal  0.26683 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6582  ribosomal protein L17  56.28 
 
 		 196 aa  192  5e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.252016  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16890  LSU ribosomal protein L17P  47.19 
 
 		 242 aa  191  1e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4969  50S ribosomal protein L17  67.28 
 
 		 199 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.392078  normal  0.37487 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3874  50S ribosomal protein L17P  72.88 
 
 		 202 aa  181  7e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1173  ribosomal protein L17  64.44 
 
 		 219 aa  181  8.000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0716  ribosomal protein L17  54.7 
 
 		 202 aa  179  4e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.237056 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4478  ribosomal protein L17  55.95 
 
 		 229 aa  177  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0807204  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2625  ribosomal protein L17  67.2 
 
 		 168 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04280  LSU ribosomal protein L17P  61.94 
 
 		 189 aa  172  3.9999999999999995e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.3407  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0594  50S ribosomal protein L17  63.78 
 
 		 190 aa  172  5e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.30992 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2617  50S ribosomal protein L17  59.04 
 
 		 172 aa  170  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4285  50S ribosomal protein L17  57.24 
 
 		 190 aa  169  4e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106968  hitchhiker  0.00521298 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3112  50S ribosomal protein L17  65.29 
 
 		 197 aa  169  5e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4289  ribosomal protein L17  65.57 
 
 		 169 aa  168  6e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3894  50S ribosomal protein L17  56.55 
 
 		 190 aa  167  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0655  ribosomal protein L17  65.29 
 
 		 178 aa  167  1e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.929452  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0965  50S ribosomal protein L17  61.31 
 
 		 176 aa  166  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.537634  normal  0.269592 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23520  LSU ribosomal protein L17P  64 
 
 		 164 aa  166  2.9999999999999998e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1119  50S ribosomal protein L17  60.94 
 
 		 176 aa  163  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.808416  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5153  ribosomal protein L17  65.52 
 
 		 179 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.186095 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1218  50S ribosomal protein L17  53.57 
 
 		 170 aa  161  8.000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0264415 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29450  LSU ribosomal protein L17P  57.66 
 
 		 180 aa  157  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0149004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0614  ribosomal protein L17  56.2 
 
 		 181 aa  156  2e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0278  ribosomal protein L17  54.55 
 
 		 144 aa  154  8e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0335  50S ribosomal protein L17P  58.82 
 
 		 222 aa  154  1e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.194907  decreased coverage  0.000408041 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0611  50S ribosomal protein L17  56.41 
 
 		 206 aa  154  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.595155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2939  50S ribosomal protein L17  59.15 
 
 		 196 aa  146  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.75004  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2654  50S ribosomal protein L17  62.4 
 
 		 190 aa  145  6e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1734  50S ribosomal protein L17  58.47 
 
 		 183 aa  144  9e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6021  50S ribosomal protein L17  57.79 
 
 		 195 aa  138  7e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.79372  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0427  ribosomal protein L17  48.25 
 
 		 118 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.75518  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1154  ribosomal protein L17  55.56 
 
 		 117 aa  116  3e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000378331  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2430  50S ribosomal protein L17  50.93 
 
 		 112 aa  116  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2036  50S ribosomal protein L17  45.7 
 
 		 152 aa  113  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000459546  normal  0.304278 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0317  50S ribosomal protein L17  45.21 
 
 		 152 aa  113  3e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0814309  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2268  50S ribosomal protein L17  52.17 
 
 		 166 aa  112  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0312187 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2830  50S ribosomal protein L17  45.65 
 
 		 175 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215711  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0654  50S ribosomal protein L17  49.12 
 
 		 178 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686686  hitchhiker  0.0000313712 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0729  50S ribosomal protein L17  44.03 
 
 		 155 aa  112  5e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01460  ribosomal protein L17  49.09 
 
 		 114 aa  111  8.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000310561  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2201  50S ribosomal protein L17  46.43 
 
 		 151 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0373281  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1570  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 138 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.207942  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0244  50S ribosomal protein L17  52.78 
 
 		 112 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0451  50S ribosomal protein L17  50.93 
 
 		 112 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000198381  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0873  50S ribosomal protein L17P  47.86 
 
 		 126 aa  110  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000802536  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2803  ribosomal protein L17  45.6 
 
 		 195 aa  110  3e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000866699  hitchhiker  0.000000348253 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05855  putative 50S ribosomal protein L17  48.28 
 
 		 156 aa  108  5e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1093  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 184 aa  109  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01460  ribosomal protein L17  45.38 
 
 		 247 aa  108  6e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.186143  normal  0.514697 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1389  50S ribosomal protein L17  48.25 
 
 		 138 aa  107  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.814135  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0451  50S ribosomal protein L17  49.09 
 
 		 119 aa  107  1e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.701542  normal  0.045023 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2320  50S ribosomal protein L17  50.93 
 
 		 138 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.116353  normal  0.244368 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3159  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 136 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.286053  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1495  ribosomal protein L17  46.3 
 
 		 113 aa  107  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.882002  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1583  ribosomal protein L17  40.43 
 
 		 151 aa  107  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0208  50S ribosomal protein L17  48.7 
 
 		 172 aa  107  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.162361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3423  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 135 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.108892 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1174  ribosomal protein L17  43.26 
 
 		 161 aa  107  2e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1716  50S ribosomal protein L17  54.46 
 
 		 113 aa  107  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574886  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2663  50S ribosomal protein L17  48.28 
 
 		 140 aa  106  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402474  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0707  50S ribosomal protein L17  46.72 
 
 		 127 aa  106  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000951753  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2395  50S ribosomal protein L17  48.7 
 
 		 147 aa  106  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.409682  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3978  ribosomal protein L17  41.86 
 
 		 139 aa  105  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0734  50S ribosomal protein L17  45.05 
 
 		 208 aa  105  6e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1456  50S ribosomal protein L17  45.9 
 
 		 127 aa  105  7e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000714244  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0896  50S ribosomal protein L17  46.3 
 
 		 112 aa  104  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000178462  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0630  ribosomal protein L17  49.53 
 
 		 183 aa  104  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1839  50S ribosomal protein L17  54.35 
 
 		 116 aa  104  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.501315  normal  0.68282 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5045  50S ribosomal protein L17  48.25 
 
 		 137 aa  103  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1506  ribosomal protein L17  47.41 
 
 		 136 aa  103  2e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000952918 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1869  50S ribosomal protein L17  44 
 
 		 141 aa  103  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1823  50S ribosomal protein L17  41.78 
 
 		 154 aa  103  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1770  50S ribosomal protein L17P  46.15 
 
 		 140 aa  103  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.44833  normal  0.342107 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3300  ribosomal protein L17  47.27 
 
 		 168 aa  103  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0299881 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0135  50S ribosomal protein L17  47.41 
 
 		 120 aa  102  4e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23271  50S ribosomal protein L17  48.15 
 
 		 116 aa  102  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17421  50S ribosomal protein L17  50.49 
 
 		 116 aa  102  5e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0315  ribosomal protein L17  46.3 
 
 		 112 aa  102  6e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.123635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0139  50S ribosomal protein L17  46.55 
 
 		 120 aa  102  6e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000316871  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1627  50S ribosomal protein L17  50.49 
 
 		 116 aa  102  6e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  48.18 
 
 		 143 aa  102  6e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1639  50S ribosomal protein L17  42.98 
 
 		 137 aa  102  7e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0620252  normal  0.0662611 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1933  50S ribosomal protein L17  44.03 
 
 		 140 aa  102  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0721548  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17261  50S ribosomal protein L17  50.49 
 
 		 116 aa  101  9e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1011  50S ribosomal protein L17  48.18 
 
 		 141 aa  101  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.264601 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0484  50S ribosomal protein L17P  44.74 
 
 		 137 aa  100  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0370  50S ribosomal protein L17  51.49 
 
 		 163 aa  101  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.547464  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1374  50S ribosomal protein L17  45.76 
 
 		 124 aa  100  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00863011  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2138  50S ribosomal protein L17  45.3 
 
 		 138 aa  100  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.968449 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3641  50S ribosomal protein L17  48.15 
 
 		 139 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.178298  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0352  50S ribosomal protein L17  48.6 
 
 		 116 aa  100  2e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.84994 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3290  50S ribosomal protein L17  45.37 
 
 		 131 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>