More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_20580 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_20580  LSU ribosomal protein L17P  100 
 
 		 268 aa  530  1e-150  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.69658 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16890  LSU ribosomal protein L17P  48.72 
 
 		 242 aa  221  9.999999999999999e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2625  ribosomal protein L17  70.66 
 
 		 168 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0716  ribosomal protein L17  61.5 
 
 		 202 aa  213  1.9999999999999998e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.237056 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4478  ribosomal protein L17  74.24 
 
 		 229 aa  208  7e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0807204  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3112  50S ribosomal protein L17  77.24 
 
 		 197 aa  208  8e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0278  ribosomal protein L17  70.63 
 
 		 144 aa  207  2e-52  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3381  ribosomal protein L17  46.59 
 
 		 233 aa  202  7e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0655  ribosomal protein L17  77.24 
 
 		 178 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.929452  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6582  ribosomal protein L17  57.79 
 
 		 196 aa  199  3.9999999999999996e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.252016  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2617  50S ribosomal protein L17  56.12 
 
 		 172 aa  194  1e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0594  50S ribosomal protein L17  76.67 
 
 		 190 aa  194  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.30992 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1734  50S ribosomal protein L17  77.31 
 
 		 183 aa  192  4e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1143  50S ribosomal protein L17  56.32 
 
 		 195 aa  190  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.25464 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04280  LSU ribosomal protein L17P  66 
 
 		 189 aa  191  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.3407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1114  50S ribosomal protein L17  56.32 
 
 		 195 aa  190  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1131  50S ribosomal protein L17  56.32 
 
 		 195 aa  190  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4289  ribosomal protein L17  73.23 
 
 		 169 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3874  50S ribosomal protein L17P  72.88 
 
 		 202 aa  189  5e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1119  50S ribosomal protein L17  64.63 
 
 		 176 aa  188  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.808416  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1173  ribosomal protein L17  72.88 
 
 		 219 aa  187  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813608  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5153  ribosomal protein L17  74.14 
 
 		 179 aa  185  7e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.186095 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0335  50S ribosomal protein L17P  65.94 
 
 		 222 aa  184  9e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.194907  decreased coverage  0.000408041 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0965  50S ribosomal protein L17  64.23 
 
 		 176 aa  184  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.537634  normal  0.269592 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0614  ribosomal protein L17  64.29 
 
 		 181 aa  184  2.0000000000000003e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3668  ribosomal protein L17  65.49 
 
 		 203 aa  183  3e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3894  50S ribosomal protein L17  50.52 
 
 		 190 aa  179  4e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4285  50S ribosomal protein L17  55 
 
 		 190 aa  177  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106968  hitchhiker  0.00521298 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13493  50S ribosomal protein L17  69.49 
 
 		 180 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00579097  normal  0.26683 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1437  50S ribosomal protein L17  70.34 
 
 		 202 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.831815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23520  LSU ribosomal protein L17P  67.46 
 
 		 164 aa  173  2.9999999999999996e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0611  50S ribosomal protein L17  64.1 
 
 		 206 aa  172  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.595155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2939  50S ribosomal protein L17  70 
 
 		 196 aa  170  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.75004  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29450  LSU ribosomal protein L17P  60.87 
 
 		 180 aa  168  9e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0149004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1218  50S ribosomal protein L17  65.25 
 
 		 170 aa  168  9e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0264415 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2654  50S ribosomal protein L17  70.08 
 
 		 190 aa  166  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4969  50S ribosomal protein L17  67.8 
 
 		 199 aa  156  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.392078  normal  0.37487 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6021  50S ribosomal protein L17  65.13 
 
 		 195 aa  150  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.79372  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2830  50S ribosomal protein L17  47.9 
 
 		 175 aa  142  6e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215711  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0654  50S ribosomal protein L17  46.41 
 
 		 178 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686686  hitchhiker  0.0000313712 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0707  50S ribosomal protein L17  53.23 
 
 		 127 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000951753  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0729  50S ribosomal protein L17  52.76 
 
 		 155 aa  136  5e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1093  50S ribosomal protein L17  55 
 
 		 184 aa  135  5e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0427  ribosomal protein L17  54.87 
 
 		 118 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.75518  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3300  ribosomal protein L17  55.45 
 
 		 168 aa  130  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0299881 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0451  50S ribosomal protein L17  56.48 
 
 		 112 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000198381  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0896  50S ribosomal protein L17  53.7 
 
 		 112 aa  127  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000178462  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1374  50S ribosomal protein L17  51.69 
 
 		 124 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00863011  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0734  50S ribosomal protein L17  52.59 
 
 		 208 aa  125  5e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0873  50S ribosomal protein L17P  50.43 
 
 		 126 aa  125  5e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000802536  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01460  ribosomal protein L17  47.11 
 
 		 247 aa  125  8.000000000000001e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.186143  normal  0.514697 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2430  50S ribosomal protein L17  52.78 
 
 		 112 aa  125  9e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0961  ribosomal protein L17  57.73 
 
 		 144 aa  122  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.463077  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2127  50S ribosomal protein L17P  49.17 
 
 		 121 aa  122  6e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0812324  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2036  50S ribosomal protein L17  51.72 
 
 		 152 aa  121  9.999999999999999e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000459546  normal  0.304278 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  48.33 
 
 		 143 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01460  ribosomal protein L17  54.55 
 
 		 114 aa  120  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000310561  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2268  50S ribosomal protein L17  51.72 
 
 		 166 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0312187 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2663  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 		 140 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402474  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1869  50S ribosomal protein L17  47.5 
 
 		 141 aa  119  4.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1583  ribosomal protein L17  42.38 
 
 		 151 aa  119  6e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2803  ribosomal protein L17  45.16 
 
 		 195 aa  119  7e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000866699  hitchhiker  0.000000348253 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1011  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 141 aa  118  7.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.264601 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0723  50S ribosomal protein L17  47.41 
 
 		 141 aa  118  9.999999999999999e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.556575  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1639  50S ribosomal protein L17  48.7 
 
 		 137 aa  118  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0620252  normal  0.0662611 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2201  50S ribosomal protein L17  50.86 
 
 		 151 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0373281  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1716  50S ribosomal protein L17  55.45 
 
 		 113 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574886  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1770  50S ribosomal protein L17P  49.57 
 
 		 140 aa  117  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.44833  normal  0.342107 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0317  50S ribosomal protein L17  50.86 
 
 		 152 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0814309  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1455  50S ribosomal protein L17  48.28 
 
 		 140 aa  115  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.026202  normal  0.30678 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0139  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 120 aa  116  5e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000316871  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05855  putative 50S ribosomal protein L17  50.86 
 
 		 156 aa  115  6e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0320  ribosomal protein L17  47.9 
 
 		 128 aa  115  6e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1823  50S ribosomal protein L17  50.86 
 
 		 154 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1357  50S ribosomal protein L17  47.41 
 
 		 140 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139721  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1495  ribosomal protein L17  51.85 
 
 		 113 aa  115  8.999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.882002  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0135  50S ribosomal protein L17  48.28 
 
 		 120 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19700  ribosomal protein L17  45 
 
 		 169 aa  115  1.0000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00763987  normal  0.431624 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0630  ribosomal protein L17  44.83 
 
 		 183 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0208  50S ribosomal protein L17  51.85 
 
 		 172 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.162361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0315  ribosomal protein L17  48.15 
 
 		 112 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.123635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2395  50S ribosomal protein L17  50.86 
 
 		 147 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.409682  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1367  ribosomal protein L17  47.01 
 
 		 117 aa  113  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2682  ribosomal protein L17  53.77 
 
 		 121 aa  113  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0293066  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2992  50S ribosomal protein L17  48.15 
 
 		 142 aa  113  3e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.40506 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2040  50S ribosomal protein L17  48.15 
 
 		 140 aa  113  4.0000000000000004e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.631241  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1570  50S ribosomal protein L17  49.07 
 
 		 138 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.207942  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0132  50S ribosomal protein L17  47.41 
 
 		 120 aa  112  5e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000831433  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0138  50S ribosomal protein L17  47.41 
 
 		 120 aa  112  5e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000943635  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0159  50S ribosomal protein L17  47.41 
 
 		 120 aa  112  5e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000799248  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0138  50S ribosomal protein L17  47.41 
 
 		 120 aa  112  5e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0133  50S ribosomal protein L17  47.41 
 
 		 120 aa  112  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000322802  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0131  50S ribosomal protein L17  47.41 
 
 		 120 aa  112  5e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.124408  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5167  50S ribosomal protein L17  47.41 
 
 		 120 aa  112  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000165629  hitchhiker  3.84135e-19 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0138  50S ribosomal protein L17  47.41 
 
 		 120 aa  112  5e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000121438  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0151  50S ribosomal protein L17  47.41 
 
 		 120 aa  112  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.34385e-50 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0133  50S ribosomal protein L17  47.41 
 
 		 120 aa  112  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000340653  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0169  50S ribosomal protein L17  47.41 
 
 		 120 aa  112  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000157984  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2684  50S ribosomal protein L17  49.07 
 
 		 113 aa  112  5e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2369  50S ribosomal protein L17  49.07 
 
 		 113 aa  112  5e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0521735  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>