32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0791 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0791  hypothetical protein  100 
 
 
319 aa  649    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0742  putative lipoprotein  99.69 
 
 
319 aa  646    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4029  hypothetical protein  79.69 
 
 
329 aa  478  1e-134  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0138  hypothetical protein  40.21 
 
 
281 aa  122  7e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.412267 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0217  hypothetical protein  44.63 
 
 
236 aa  98.2  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530241  normal  0.176582 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0188  hypothetical protein  36.65 
 
 
238 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  34.68 
 
 
212 aa  70.5  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0594  Excalibur domain-containing protein  32.9 
 
 
211 aa  70.1  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.187659 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0782  nuclease (SNase-like)  31.68 
 
 
242 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180998  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5017  nuclease  36.47 
 
 
167 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.177044 
 
 
-
 
NC_004310  BR0870  nuclease domain-containing protein  33.33 
 
 
189 aa  55.1  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4628  SNase-like nuclease  31.73 
 
 
242 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0862  nuclease domain-containing protein  33.33 
 
 
189 aa  55.1  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0859  nuclease (SNase domain protein)  36.59 
 
 
243 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2156  nuclease (SNase domain protein)  30.93 
 
 
177 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2576  nuclease (SNase domain protein)  26.61 
 
 
358 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.901293  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2193  nuclease  32.1 
 
 
177 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2471  nuclease (SNase domain protein)  32.1 
 
 
177 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4484  nuclease (SNase domain protein)  30.89 
 
 
211 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.270396  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4688  nuclease (SNase-like)  31.76 
 
 
241 aa  50.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4116  nuclease  30.89 
 
 
209 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.373469  normal  0.63366 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0545  putative nuclease-like protein  32.94 
 
 
241 aa  50.1  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0379373  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4597  nuclease (SNase domain protein)  29.63 
 
 
208 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0232149  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0317  nuclease (SNase domain protein)  31.96 
 
 
227 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183306  normal  0.136686 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0065  nuclease  30.93 
 
 
227 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0111  nuclease  31.96 
 
 
227 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2357  nuclease  29.7 
 
 
221 aa  46.6  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2244  nuclease  28.87 
 
 
534 aa  45.4  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000544674  normal  0.0168792 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1886  nuclease  34.02 
 
 
192 aa  45.8  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0247855 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1554  nuclease (SNase-like)  30.83 
 
 
202 aa  43.9  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6820  nuclease (SNase domain protein)  31.13 
 
 
226 aa  43.5  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0330594  normal  0.398913 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1730  nuclease  30.19 
 
 
175 aa  42.7  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0510494  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>