24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4113 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4113  hypothetical protein  100 
 
 		 423 aa  818    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.226985 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1569  hypothetical protein  44.74 
 
 		 436 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.39928  normal  0.0673531 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1848  hypothetical protein  44.44 
 
 		 436 aa  238  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.333329  normal  0.515923 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1670  hypothetical protein  76.92 
 
 		 430 aa  172  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.299768  normal  0.863632 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4939  hypothetical protein  49.45 
 
 		 407 aa  149  7e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2554  hypothetical protein  46.39 
 
 		 407 aa  134  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.315018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0506  penicillin-binding protein, 1A family  48.78 
 
 		 796 aa  114  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396512  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1046  1A family penicillin-binding protein  54 
 
 		 810 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5115  glycosyl transferase family 51  51.52 
 
 		 660 aa  101  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3022  glycosyl transferase family protein  50.51 
 
 		 681 aa  99  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.043835 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2520  penicillin-binding protein 1A  54.17 
 
 		 750 aa  94.7  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0677  penicillin-binding protein, 1A family  40 
 
 		 815 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.187464 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3611  1A family penicillin-binding protein  45.1 
 
 		 814 aa  87  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.246117  hitchhiker  0.00429634 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0719  penicillin-binding protein, 1A family  42.16 
 
 		 830 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347949  normal  0.695169 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0706  1A family penicillin-binding protein  43.14 
 
 		 830 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.679519  normal  0.247814 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4597  nuclease (SNase domain protein)  33.06 
 
 		 208 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0232149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1258  hypothetical protein  32.7 
 
 		 431 aa  48.9  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0255884 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5017  nuclease  30.83 
 
 		 167 aa  47  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.177044 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4484  nuclease (SNase domain protein)  31.97 
 
 		 211 aa  47  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.270396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4116  nuclease  29.17 
 
 		 209 aa  46.6  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.373469  normal  0.63366 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0065  nuclease  30.95 
 
 		 227 aa  45.8  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1886  nuclease  30.43 
 
 		 192 aa  45.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0247855 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  31.67 
 
 		 214 aa  43.9  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2002  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  38.57 
 
 		 266 aa  43.9  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.129661  normal  0.0718181 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>