More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5115 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3022  glycosyl transferase family protein  69.32 
 
 		 681 aa  760    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.043835 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5115  glycosyl transferase family 51  100 
 
 		 660 aa  1254    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0506  penicillin-binding protein, 1A family  43.79 
 
 		 796 aa  220  7e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396512  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1046  1A family penicillin-binding protein  40.96 
 
 		 810 aa  207  4e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0677  penicillin-binding protein, 1A family  36.36 
 
 		 815 aa  158  3e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.187464 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0453  penicillin-binding protein 1A  34.36 
 
 		 757 aa  152  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.287636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0719  penicillin-binding protein, 1A family  35.22 
 
 		 830 aa  152  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347949  normal  0.695169 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0706  1A family penicillin-binding protein  35.22 
 
 		 830 aa  152  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.679519  normal  0.247814 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  33.43 
 
 		 727 aa  150  8e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  33.72 
 
 		 727 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  33.14 
 
 		 728 aa  147  5e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  34.13 
 
 		 734 aa  145  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  34.47 
 
 		 739 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  33.43 
 
 		 728 aa  145  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  33.62 
 
 		 735 aa  143  9e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  33.53 
 
 		 714 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  35.31 
 
 		 741 aa  141  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.244077 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  33.44 
 
 		 732 aa  141  4.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  34.85 
 
 		 720 aa  137  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  31.75 
 
 		 734 aa  137  9e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  32.94 
 
 		 714 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3611  1A family penicillin-binding protein  35.28 
 
 		 814 aa  135  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.246117  hitchhiker  0.00429634 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2520  penicillin-binding protein 1A  31.93 
 
 		 750 aa  135  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1701  1A family penicillin-binding protein  30.56 
 
 		 626 aa  133  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41226  normal  0.0892672 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0767  penicillin-binding protein, 1A family  30.58 
 
 		 763 aa  131  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.210188  normal  0.891602 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6858  penicillin-binding protein, 1A family  30.31 
 
 		 626 aa  130  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  32.58 
 
 		 833 aa  129  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  31.32 
 
 		 720 aa  128  3e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  28.33 
 
 		 770 aa  125  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  30.82 
 
 		 712 aa  123  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1078  1A family penicillin-binding protein  31.42 
 
 		 727 aa  123  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.319269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1453  penicillin-binding protein 1A  31.41 
 
 		 699 aa  122  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.8478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0897  1A family penicillin-binding protein  31.29 
 
 		 691 aa  120  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0008  1A family penicillin-binding protein  30.39 
 
 		 775 aa  119  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000321042 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0114  1A family penicillin-binding protein  29.09 
 
 		 730 aa  118  3e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.572692  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0117  1A family penicillin-binding protein  29.09 
 
 		 763 aa  118  3.9999999999999997e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4097  penicillin-binding protein, 1A family  31.38 
 
 		 776 aa  117  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3986  1A family penicillin-binding protein  32.71 
 
 		 723 aa  117  7.999999999999999e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  31.85 
 
 		 779 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3388  1A family penicillin-binding protein  31.23 
 
 		 750 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2628  penicillin-binding protein 1A  30.56 
 
 		 735 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0203  1A family penicillin-binding protein  32.29 
 
 		 658 aa  115  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0142  penicillin-binding protein  30.99 
 
 		 729 aa  114  6e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4406  1A family penicillin-binding protein  29.5 
 
 		 818 aa  114  8.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000928316  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3133  1A family penicillin-binding protein  31.37 
 
 		 796 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0583  1A family penicillin-binding protein  30.52 
 
 		 724 aa  113  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3393  penicillin-binding protein 1A  32.67 
 
 		 651 aa  111  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2677  1A family penicillin-binding protein  29.97 
 
 		 724 aa  111  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.288371  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0583  1A family penicillin-binding protein  30.19 
 
 		 718 aa  110  7.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.161794  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0754  penicillin-binding protein, 1A family  31.8 
 
 		 818 aa  110  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000281003  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3352  penicillin-binding protein, 1A family  30.28 
 
 		 683 aa  108  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00461101  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0887  glycosyl transferase family protein  30.79 
 
 		 831 aa  108  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.656493  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2548  1A family penicillin-binding protein  30.46 
 
 		 788 aa  108  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.340929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0118  1A family penicillin-binding protein  29.08 
 
 		 788 aa  107  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1403  penicillin-binding protein 1A  29.66 
 
 		 760 aa  107  9e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2976  penicillin-binding protein 1A  29.97 
 
 		 732 aa  105  4e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.706338  normal  0.0468757 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1150  penicillin-binding protein 1A  29.12 
 
 		 759 aa  104  5e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3921  1A family penicillin-binding protein  30.49 
 
 		 712 aa  104  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0187238 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3462  penicillin-binding protein, 1A family  30.16 
 
 		 681 aa  103  9e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0395  penicillin-binding protein, 1A family  31.13 
 
 		 709 aa  103  9e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.14301  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2871  1A family penicillin-binding protein  35.55 
 
 		 860 aa  103  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3888  1A family penicillin-binding protein  25.35 
 
 		 683 aa  103  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.318045  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1670  hypothetical protein  52.53 
 
 		 430 aa  103  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.299768  normal  0.863632 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1803  1A family penicillin-binding protein  27.89 
 
 		 708 aa  103  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1662  penicillin-binding protein, 1A family  27.92 
 
 		 742 aa  102  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.460487 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1653  1A family penicillin-binding protein  27.83 
 
 		 768 aa  102  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.64242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3056  putative penicillin-binding protein  29.84 
 
 		 759 aa  102  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3011  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  26.65 
 
 		 750 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3195  1A family penicillin-binding protein  28.35 
 
 		 773 aa  102  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3506  penicillin-binding protein 1A  28.98 
 
 		 769 aa  102  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.430284 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1787  penicillin-binding protein 1A  30.3 
 
 		 757 aa  102  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.495648  normal  0.0540885 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  27.6 
 
 		 649 aa  102  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2073  penicillin-binding protein, 1A family  29.92 
 
 		 758 aa  102  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3106  family 51 glycosyl transferase  28.66 
 
 		 719 aa  102  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265076  hitchhiker  0.000700529 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1848  hypothetical protein  51.52 
 
 		 436 aa  101  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.333329  normal  0.515923 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1569  hypothetical protein  51.52 
 
 		 436 aa  101  5e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.39928  normal  0.0673531 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0720  penicillin-binding protein, 1A family  30.69 
 
 		 744 aa  101  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0942081  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4939  hypothetical protein  44.88 
 
 		 407 aa  101  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4113  hypothetical protein  51.52 
 
 		 423 aa  101  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.226985 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  30 
 
 		 765 aa  101  6e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0324  penicillin-binding protein, 1A family  29.58 
 
 		 802 aa  100  7e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2868  1A family penicillin-binding protein  32.32 
 
 		 669 aa  100  7e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0010427  normal  0.721279 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0195  family 51 glycosyl transferase  29.61 
 
 		 739 aa  100  8e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.89929 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1627  1A family penicillin-binding protein  29.27 
 
 		 718 aa  100  9e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.216077 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3329  penicillin-binding protein 1A  30.93 
 
 		 712 aa  100  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1953  penicillin-binding protein 1A  29.31 
 
 		 750 aa  100  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.330059 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0189  penicillin-binding protein, 1A family  27.46 
 
 		 827 aa  99.4  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1421  penicillin-binding protein, 1A family  30.41 
 
 		 801 aa  98.2  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0739  penicillin-binding protein, 1A family  24.93 
 
 		 668 aa  98.2  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0171  penicillin-binding protein, 1A family  28.14 
 
 		 829 aa  98.2  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000166752 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0864  penicillin-binding protein, 1A family  29.66 
 
 		 760 aa  97.8  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.930859 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0354  penicillin-binding protein 1A  31.25 
 
 		 841 aa  97.8  6e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.75585  normal  0.103015 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0928  1A family penicillin-binding protein  29.66 
 
 		 784 aa  97.4  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1431  glycosyl transferase family protein  36.08 
 
 		 300 aa  97.4  7e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.588983  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3099  glycosyl transferase family 51  30.69 
 
 		 838 aa  97.4  8e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.113974  hitchhiker  0.000163958 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0889  penicillin-binding protein, 1A family  29.66 
 
 		 765 aa  97.4  8e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.53881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2817  1A family penicillin-binding protein  31.53 
 
 		 709 aa  97.4  8e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.515125  normal  0.127975 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0209  penicillin-binding protein 1A  33.33 
 
 		 771 aa  96.7  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1108  penicillin-binding protein 1A  28.57 
 
 		 846 aa  96.3  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2715  penicillin-binding protein 1A  28.06 
 
 		 832 aa  95.5  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>