More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1431 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1431  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 300 aa  610  9.999999999999999e-175  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.588983  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0203  1A family penicillin-binding protein  68.21 
 
 		 658 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0767  penicillin-binding protein, 1A family  53.15 
 
 		 763 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.210188  normal  0.891602 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6858  penicillin-binding protein, 1A family  51.85 
 
 		 626 aa  250  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0506  penicillin-binding protein, 1A family  55.19 
 
 		 796 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396512  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3393  penicillin-binding protein 1A  59.64 
 
 		 651 aa  196  6e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2520  penicillin-binding protein 1A  55.25 
 
 		 750 aa  191  9e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  50 
 
 		 727 aa  189  7e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  48.36 
 
 		 761 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0897  1A family penicillin-binding protein  53.85 
 
 		 691 aa  182  7e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1078  1A family penicillin-binding protein  52.33 
 
 		 727 aa  181  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.319269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  43.22 
 
 		 770 aa  181  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1046  1A family penicillin-binding protein  51.37 
 
 		 810 aa  179  7e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1150  penicillin-binding protein 1A  50 
 
 		 759 aa  178  8e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0583  1A family penicillin-binding protein  48.9 
 
 		 724 aa  178  9e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1787  penicillin-binding protein 1A  50 
 
 		 757 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.495648  normal  0.0540885 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0008  1A family penicillin-binding protein  48.72 
 
 		 775 aa  178  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000321042 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3506  penicillin-binding protein 1A  48.9 
 
 		 769 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.430284 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3056  putative penicillin-binding protein  49.44 
 
 		 759 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0583  1A family penicillin-binding protein  48.35 
 
 		 718 aa  176  3e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.161794  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0324  penicillin-binding protein, 1A family  54.55 
 
 		 802 aa  177  3e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2797  penicillin-binding protein, 1A family  52.46 
 
 		 677 aa  176  4e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1953  penicillin-binding protein 1A  48.35 
 
 		 750 aa  176  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.330059 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1403  penicillin-binding protein 1A  49.44 
 
 		 760 aa  175  8e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  55.13 
 
 		 720 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2677  1A family penicillin-binding protein  47.25 
 
 		 724 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.288371  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  51.76 
 
 		 739 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0823  1A family penicillin-binding protein  48.84 
 
 		 705 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0117  1A family penicillin-binding protein  42.92 
 
 		 763 aa  172  3.9999999999999995e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0114  1A family penicillin-binding protein  42.92 
 
 		 730 aa  172  3.9999999999999995e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.572692  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2073  penicillin-binding protein, 1A family  47.8 
 
 		 758 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1653  1A family penicillin-binding protein  48.91 
 
 		 768 aa  171  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.64242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  41.98 
 
 		 741 aa  171  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.244077 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  49.72 
 
 		 905 aa  169  3e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  53.21 
 
 		 735 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1701  1A family penicillin-binding protein  46.45 
 
 		 626 aa  170  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41226  normal  0.0892672 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1948  1A family penicillin-binding protein  45.45 
 
 		 855 aa  170  3e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2885  penicillin-binding protein, 1A family  46.59 
 
 		 705 aa  170  3e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.060613  normal  0.0841224 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  47.59 
 
 		 649 aa  169  4e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  41.04 
 
 		 734 aa  169  5e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  45.88 
 
 		 833 aa  167  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1574  penicillin-binding protein 1A  50.29 
 
 		 692 aa  167  2e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.53157  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4097  penicillin-binding protein, 1A family  40.25 
 
 		 776 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  40.48 
 
 		 765 aa  166  4e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2676  1A family penicillin-binding protein  49.71 
 
 		 795 aa  165  6.9999999999999995e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.21019 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0883  1A family penicillin-binding protein  51.2 
 
 		 714 aa  165  8e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1662  penicillin-binding protein, 1A family  49.13 
 
 		 742 aa  165  9e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.460487 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0739  penicillin-binding protein, 1A family  48 
 
 		 668 aa  165  9e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0395  penicillin-binding protein, 1A family  47 
 
 		 709 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.14301  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3124  penicillin-binding protein 1A  53.25 
 
 		 807 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.31223  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1627  1A family penicillin-binding protein  49.71 
 
 		 718 aa  164  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.216077 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  48.19 
 
 		 712 aa  164  1.0000000000000001e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1453  penicillin-binding protein 1A  47.45 
 
 		 699 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.8478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  48.6 
 
 		 734 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  51.92 
 
 		 732 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  49.1 
 
 		 779 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  50.3 
 
 		 648 aa  163  3e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2868  1A family penicillin-binding protein  49.49 
 
 		 669 aa  163  3e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0010427  normal  0.721279 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0805  penicillin-binding protein 1A  46.15 
 
 		 680 aa  163  4.0000000000000004e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0444532  normal  0.0112407 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0998  penicillin-binding protein 1  47.09 
 
 		 705 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1069  penicillin-binding protein 1  47.09 
 
 		 705 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0983  penicillin-binding protein 1  47.09 
 
 		 705 aa  162  6e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  45.7 
 
 		 643 aa  162  7e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1151  penicillin-binding protein 1  46.51 
 
 		 705 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0985  penicillin-binding protein 1  46.51 
 
 		 705 aa  162  9e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04821  putative penicillin binding protein  45.56 
 
 		 589 aa  160  2e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.725323  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0511  penicillin-binding protein, 1A family  45.36 
 
 		 901 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  48.65 
 
 		 714 aa  160  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2648  penicillin-binding protein, 1A family  45.14 
 
 		 814 aa  160  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.213317  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3834  1A family penicillin-binding protein  45.23 
 
 		 861 aa  160  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3986  1A family penicillin-binding protein  43.39 
 
 		 723 aa  160  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3611  1A family penicillin-binding protein  48.63 
 
 		 814 aa  160  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.246117  hitchhiker  0.00429634 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1229  penicillin-binding protein 1  46.51 
 
 		 705 aa  159  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1166  penicillin-binding protein 1  46.51 
 
 		 746 aa  159  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  51.25 
 
 		 712 aa  159  4e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0677  penicillin-binding protein, 1A family  52.51 
 
 		 815 aa  159  4e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.187464 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0024  penicillin-binding protein, 1A family  39.53 
 
 		 802 aa  159  4e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  49.41 
 
 		 727 aa  159  5e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  49.41 
 
 		 727 aa  159  6e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2321  1A family penicillin-binding protein  46.93 
 
 		 862 aa  159  6e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.10527  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  44.44 
 
 		 776 aa  159  7e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  51.28 
 
 		 714 aa  159  7e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0293  Peptidoglycan glycosyltransferase  48.39 
 
 		 834 aa  158  8e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1180  1A family penicillin-binding protein  40.31 
 
 		 679 aa  159  8e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000474619  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1109  peptidoglycan glycosyltransferase  46.47 
 
 		 795 aa  158  8e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000046818  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4203  penicillin-binding protein 1  45.93 
 
 		 705 aa  158  9e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  51.92 
 
 		 727 aa  158  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0354  penicillin-binding protein 1A  47.16 
 
 		 841 aa  158  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.75585  normal  0.103015 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1547  penicillin-binding protein  42.11 
 
 		 667 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000544476 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0041  glycosyl transferase family protein  40 
 
 		 643 aa  158  1e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000612567  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1378  1A family penicillin-binding protein  42.35 
 
 		 679 aa  158  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000265206  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0041  glycosyl transferase family protein  40 
 
 		 643 aa  158  1e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0770668  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3835  penicillin-binding protein 1F (PBP-1F)  42 
 
 		 680 aa  157  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.288255  hitchhiker  0.000000000138665 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1672  penicillin-binding protein, putative  47.73 
 
 		 759 aa  157  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  48.82 
 
 		 728 aa  157  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1337  penicillin-binding protein 2A  41.58 
 
 		 680 aa  157  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1474  penicillin-binding protein  41.58 
 
 		 673 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0083684  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  40.49 
 
 		 811 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0720  penicillin-binding protein, 1A family  46.84 
 
 		 744 aa  157  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0942081  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1510  penicillin-binding protein  42.11 
 
 		 680 aa  157  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00148274  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>