23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4939 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4939  hypothetical protein  100 
 
 		 407 aa  786    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2554  hypothetical protein  72 
 
 		 407 aa  237  3e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.315018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4113  hypothetical protein  48.98 
 
 		 423 aa  151  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.226985 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1670  hypothetical protein  61.11 
 
 		 430 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.299768  normal  0.863632 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1848  hypothetical protein  59.29 
 
 		 436 aa  144  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.333329  normal  0.515923 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1569  hypothetical protein  59.29 
 
 		 436 aa  145  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.39928  normal  0.0673531 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0506  penicillin-binding protein, 1A family  54.95 
 
 		 796 aa  120  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396512  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1046  1A family penicillin-binding protein  54.63 
 
 		 810 aa  116  6e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5115  glycosyl transferase family 51  44.88 
 
 		 660 aa  100  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3022  glycosyl transferase family protein  50.5 
 
 		 681 aa  99  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.043835 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2520  penicillin-binding protein 1A  52.08 
 
 		 750 aa  94.7  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0677  penicillin-binding protein, 1A family  46.73 
 
 		 815 aa  92  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.187464 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3611  1A family penicillin-binding protein  47 
 
 		 814 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.246117  hitchhiker  0.00429634 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0706  1A family penicillin-binding protein  47 
 
 		 830 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.679519  normal  0.247814 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0719  penicillin-binding protein, 1A family  47 
 
 		 830 aa  86.7  7e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347949  normal  0.695169 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4116  nuclease  31.25 
 
 		 209 aa  53.5  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.373469  normal  0.63366 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4597  nuclease (SNase domain protein)  31.85 
 
 		 208 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0232149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4484  nuclease (SNase domain protein)  32.31 
 
 		 211 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.270396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5017  nuclease  29.03 
 
 		 167 aa  44.7  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.177044 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1969  nuclease (SNase-like)  28.72 
 
 		 172 aa  44.7  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1258  hypothetical protein  32.11 
 
 		 431 aa  44.3  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0255884 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1886  nuclease  29.17 
 
 		 192 aa  43.9  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0247855 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0065  nuclease  26.67 
 
 		 227 aa  42.7  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>