More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3022 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5115  glycosyl transferase family 51  69.25 
 
 		 660 aa  758    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3022  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 681 aa  1274    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.043835 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0506  penicillin-binding protein, 1A family  41.95 
 
 		 796 aa  209  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396512  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1046  1A family penicillin-binding protein  39.66 
 
 		 810 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  34.24 
 
 		 727 aa  158  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  34.24 
 
 		 727 aa  158  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  34.85 
 
 		 728 aa  155  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3611  1A family penicillin-binding protein  39.45 
 
 		 814 aa  154  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.246117  hitchhiker  0.00429634 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  33.64 
 
 		 728 aa  153  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0677  penicillin-binding protein, 1A family  37.11 
 
 		 815 aa  151  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.187464 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0719  penicillin-binding protein, 1A family  36.39 
 
 		 830 aa  150  9e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347949  normal  0.695169 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0706  1A family penicillin-binding protein  36.39 
 
 		 830 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.679519  normal  0.247814 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  32.98 
 
 		 734 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  30.88 
 
 		 739 aa  148  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  33.94 
 
 		 714 aa  148  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  34.15 
 
 		 714 aa  148  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  34.33 
 
 		 732 aa  148  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0453  penicillin-binding protein 1A  33.51 
 
 		 757 aa  147  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.287636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  32.46 
 
 		 735 aa  146  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  34.51 
 
 		 741 aa  144  5e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.244077 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1701  1A family penicillin-binding protein  33.95 
 
 		 626 aa  143  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41226  normal  0.0892672 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  32.24 
 
 		 734 aa  139  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  29.98 
 
 		 720 aa  138  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2520  penicillin-binding protein 1A  35.69 
 
 		 750 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0767  penicillin-binding protein, 1A family  30.56 
 
 		 763 aa  134  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.210188  normal  0.891602 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  30.27 
 
 		 770 aa  134  5e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  31.75 
 
 		 720 aa  130  5.0000000000000004e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1078  1A family penicillin-binding protein  32.87 
 
 		 727 aa  129  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.319269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  29.83 
 
 		 833 aa  129  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1453  penicillin-binding protein 1A  31.96 
 
 		 699 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.8478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  30.88 
 
 		 765 aa  128  3e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  32.1 
 
 		 712 aa  128  4.0000000000000003e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6858  penicillin-binding protein, 1A family  30.9 
 
 		 626 aa  128  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0583  1A family penicillin-binding protein  29.85 
 
 		 724 aa  127  8.000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1787  penicillin-binding protein 1A  30.14 
 
 		 757 aa  127  9e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.495648  normal  0.0540885 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0897  1A family penicillin-binding protein  33.33 
 
 		 691 aa  126  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1662  penicillin-binding protein, 1A family  30.98 
 
 		 742 aa  127  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.460487 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2677  1A family penicillin-binding protein  29.82 
 
 		 724 aa  126  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.288371  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0008  1A family penicillin-binding protein  32.63 
 
 		 775 aa  125  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000321042 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3352  penicillin-binding protein, 1A family  28.16 
 
 		 683 aa  125  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00461101  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0583  1A family penicillin-binding protein  29.33 
 
 		 718 aa  125  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.161794  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1403  penicillin-binding protein 1A  31 
 
 		 760 aa  124  5e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1627  1A family penicillin-binding protein  29.74 
 
 		 718 aa  124  5e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.216077 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1653  1A family penicillin-binding protein  29.67 
 
 		 768 aa  124  6e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.64242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1150  penicillin-binding protein 1A  31.23 
 
 		 759 aa  124  7e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0117  1A family penicillin-binding protein  29.9 
 
 		 763 aa  124  8e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0114  1A family penicillin-binding protein  31.38 
 
 		 730 aa  124  8e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.572692  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0864  penicillin-binding protein, 1A family  31.23 
 
 		 760 aa  124  8e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.930859 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4097  penicillin-binding protein, 1A family  31.75 
 
 		 776 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3388  1A family penicillin-binding protein  30.63 
 
 		 750 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  32.09 
 
 		 779 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3888  1A family penicillin-binding protein  28.77 
 
 		 683 aa  122  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.318045  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0928  1A family penicillin-binding protein  32 
 
 		 784 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0889  penicillin-binding protein, 1A family  32 
 
 		 765 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.53881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3056  putative penicillin-binding protein  29.05 
 
 		 759 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4406  1A family penicillin-binding protein  29.26 
 
 		 818 aa  121  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000928316  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1953  penicillin-binding protein 1A  30.79 
 
 		 750 aa  120  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.330059 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3506  penicillin-binding protein 1A  31.06 
 
 		 769 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.430284 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2073  penicillin-binding protein, 1A family  30.56 
 
 		 758 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0395  penicillin-binding protein, 1A family  31.82 
 
 		 709 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.14301  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2976  penicillin-binding protein 1A  31.25 
 
 		 732 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.706338  normal  0.0468757 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3809  peptidoglycan synthetase  27.83 
 
 		 850 aa  119  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1323  penicillin binding protein  30.14 
 
 		 707 aa  116  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.295305  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3462  penicillin-binding protein, 1A family  28.44 
 
 		 681 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0324  penicillin-binding protein, 1A family  31.25 
 
 		 802 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  27.14 
 
 		 648 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0754  penicillin-binding protein, 1A family  29.32 
 
 		 818 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000281003  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2628  penicillin-binding protein 1A  29.41 
 
 		 735 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0354  penicillin-binding protein 1A  26.65 
 
 		 841 aa  115  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.75585  normal  0.103015 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0720  penicillin-binding protein, 1A family  33.23 
 
 		 744 aa  115  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0942081  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3133  1A family penicillin-binding protein  29.29 
 
 		 796 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1803  1A family penicillin-binding protein  28.94 
 
 		 708 aa  114  6e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0010  peptidoglycan synthetase; penicillin-binding protein 1A  29.84 
 
 		 797 aa  114  8.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000754529  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1022  penicillin-binding protein, 1A family  31.01 
 
 		 736 aa  113  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.53642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3921  1A family penicillin-binding protein  32.79 
 
 		 712 aa  113  9e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0187238 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0317  penicillin-binding protein, 1A family  27.27 
 
 		 850 aa  113  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0332  peptidoglycan synthetase  27.49 
 
 		 851 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3773  peptidoglycan synthetase  29.35 
 
 		 850 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0142  penicillin-binding protein  29.56 
 
 		 729 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  29.71 
 
 		 618 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03248  fused penicillin-binding protein 1a: murein transglycosylase/murein transpeptidase  29.35 
 
 		 850 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.952695  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0317  peptidoglycan synthetase  27.27 
 
 		 850 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.47804  normal  0.149248 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4701  peptidoglycan synthetase  29.35 
 
 		 850 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3591  peptidoglycan synthetase  27.27 
 
 		 850 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.322941  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0894  penicillin-binding protein, 1A family  30.03 
 
 		 728 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3867  peptidoglycan synthetase  29.35 
 
 		 850 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.505357  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0253  peptidoglycan synthetase  26.95 
 
 		 852 aa  112  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.570569  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3690  peptidoglycan synthetase  29.35 
 
 		 850 aa  111  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3673  peptidoglycan synthetase  29.03 
 
 		 858 aa  111  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0454505  normal  0.370172 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3195  1A family penicillin-binding protein  27.51 
 
 		 773 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3393  penicillin-binding protein 1A  31.2 
 
 		 651 aa  111  5e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3765  peptidoglycan synthetase  29.35 
 
 		 850 aa  111  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3799  peptidoglycan synthetase  29.35 
 
 		 850 aa  111  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3692  peptidoglycan synthetase  29.35 
 
 		 850 aa  110  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3986  1A family penicillin-binding protein  29.38 
 
 		 723 aa  110  6e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2630  penicillin-binding protein, 1A family  28.74 
 
 		 807 aa  110  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0203  1A family penicillin-binding protein  30.24 
 
 		 658 aa  110  7.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  30.28 
 
 		 751 aa  110  9.000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3862  peptidoglycan synthetase  29.03 
 
 		 850 aa  110  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2605  1A family penicillin-binding protein  38.69 
 
 		 853 aa  110  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>