104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_9251 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_9251  predicted protein  100 
 
 		 164 aa  339  8e-93  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02570  mitochondrion protein, putative  42.35 
 
 		 282 aa  128  3e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.514055  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29232  predicted protein  39.52 
 
 		 235 aa  104  6e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.39353 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00258  staphylococcal nuclease domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03430)  37.1 
 
 		 280 aa  101  6e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0130052 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45339  predicted protein  41.81 
 
 		 334 aa  100  8e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1199  nuclease, putative  33.13 
 
 		 187 aa  74.7  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000552466  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  32.08 
 
 		 171 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0021  nuclease domain-containing protein  32.1 
 
 		 175 aa  71.6  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0439144  hitchhiker  0.0000334812 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  29.11 
 
 		 169 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  34.39 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  31.08 
 
 		 178 aa  64.3  0.0000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000025104  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  29.41 
 
 		 180 aa  63.9  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1385  thermonuclease  33.33 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000128794  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1412  thermonuclease  33.33 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000099778  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  28.99 
 
 		 183 aa  61.6  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1359  nuclease (SNase domain protein)  26.71 
 
 		 191 aa  61.2  0.000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104697  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2501  nuclease  26.71 
 
 		 205 aa  60.8  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.080015  normal  0.0413796 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  28.38 
 
 		 238 aa  60.8  0.000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  31.08 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  31.25 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47870  SNase-like protein  29.19 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08950  nuclease  33.91 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870151  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  30.41 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  30.37 
 
 		 158 aa  57.4  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  30.46 
 
 		 244 aa  57.4  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0143  putative nuclease  29.41 
 
 		 193 aa  57  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  unclonable  0.000000000478675  hitchhiker  0.000499621 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2377  SNase-like nuclease  30.25 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0106322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3683  nuclease  32.89 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1456  nuclease (SNase domain protein)  28.75 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  30.07 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0952  nuclease (SNase-like)  31.54 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  31.76 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  29.05 
 
 		 232 aa  54.3  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  27.65 
 
 		 187 aa  53.5  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0848  nuclease-like protein  30.08 
 
 		 184 aa  53.1  0.000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0898613  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  31.76 
 
 		 153 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25810  nuclease  26.45 
 
 		 169 aa  53.9  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.823432  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3662  nuclease (SNase domain protein)  26.88 
 
 		 175 aa  53.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.808999  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1627  nuclease (SNase domain protein)  29.87 
 
 		 221 aa  53.1  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.839518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0779  nuclease (SNase domain protein)  27.88 
 
 		 169 aa  52.8  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2515  nuclease (SNase domain protein)  30.52 
 
 		 221 aa  52.8  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.893874 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  27.7 
 
 		 227 aa  52.4  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2942  prophage MuMc02, nuclease, putative  27.67 
 
 		 216 aa  51.2  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1593  nuclease-like protein  32.17 
 
 		 196 aa  50.8  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  28.57 
 
 		 156 aa  51.2  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  28.86 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  27.03 
 
 		 174 aa  50.4  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0290  SNase-like nuclease  29.25 
 
 		 227 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00761  hypothetical protein  34.18 
 
 		 155 aa  50.1  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.489486 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51840  nuclease  27.64 
 
 		 185 aa  49.7  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1464  micrococcal nuclease  25.33 
 
 		 150 aa  48.9  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0753  nuclease  29.91 
 
 		 237 aa  48.9  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.838035  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2245  nuclease (SNase domain protein)  30.46 
 
 		 183 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  27.4 
 
 		 192 aa  48.5  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0156  nuclease (SNase-like)  25.85 
 
 		 228 aa  48.1  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216151  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2776  nuclease (SNase-like)  26.32 
 
 		 186 aa  47.8  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0816  micrococcal nuclease  27.27 
 
 		 228 aa  47.8  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000405887  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0832  micrococcal nuclease  27.27 
 
 		 228 aa  47.8  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000140573  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0480  nuclease  30.7 
 
 		 136 aa  48.1  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.898976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3848  nuclease  28.48 
 
 		 186 aa  48.1  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  29.14 
 
 		 175 aa  47.8  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1682  nuclease (SNase-like)  25.31 
 
 		 153 aa  47.4  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0199869  normal  0.0644244 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0400  nuclease  27.56 
 
 		 267 aa  47  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.246467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0402  nuclease (SNase-like)  29.2 
 
 		 260 aa  47  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0781  nuclease (SNase-like)  33.33 
 
 		 114 aa  47  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0368621  normal  0.0365666 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  30.7 
 
 		 162 aa  46.6  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  28.48 
 
 		 175 aa  47  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1341  nuclease (SNase domain protein)  27.33 
 
 		 271 aa  47  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.223732  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06071  micrococcal nuclease  35.44 
 
 		 185 aa  46.6  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.312315  normal  0.542138 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2340  nuclease (SNase domain protein)  26 
 
 		 162 aa  46.2  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2219  nuclease (SNase domain protein)  34.69 
 
 		 205 aa  46.6  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0658  nuclease (SNase domain protein)  28.86 
 
 		 171 aa  45.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688137  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  28.48 
 
 		 175 aa  45.8  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4496  nuclease  27.78 
 
 		 187 aa  45.1  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19010  nuclease  23.18 
 
 		 167 aa  45.1  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.461402  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00242  transcription factor (Snd1/p100), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G09250)  26.55 
 
 		 882 aa  45.1  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.15453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0538  nuclease  25.62 
 
 		 266 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0060  nuclease  25.81 
 
 		 351 aa  44.7  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  30.51 
 
 		 166 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0447  nuclease (SNase-like)  29.73 
 
 		 157 aa  44.7  0.0006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0276095  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  28.19 
 
 		 161 aa  44.3  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2364  nuclease (SNase domain protein)  23.65 
 
 		 171 aa  44.3  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000986149  hitchhiker  0.0000256205 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0454  nuclease (SNase domain protein)  28.86 
 
 		 192 aa  44.3  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2807  nuclease (SNase-like)  32.52 
 
 		 178 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00150481  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0569  nuclease  25.86 
 
 		 192 aa  43.5  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0193  nuclease  29.25 
 
 		 182 aa  43.5  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0103  thermonuclease  28.1 
 
 		 209 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.244407  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9903  succinoglycan biosynthesis protein  27.68 
 
 		 168 aa  43.1  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5135  staphylococcal nuclease-like protein  35.44 
 
 		 247 aa  42.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2029  nuclease (SNase-like)  30.09 
 
 		 161 aa  42.4  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3427  nuclease  28.57 
 
 		 263 aa  42.4  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.983203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1889  nuclease (SNase domain protein)  34.4 
 
 		 224 aa  42.4  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.058729  normal  0.0179002 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1912  nuclease (SNase-like)  26.23 
 
 		 323 aa  42  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183465  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0755  nuclease (SNase-like)  29.58 
 
 		 166 aa  42  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41180  nuclease  24.22 
 
 		 138 aa  41.6  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.804446  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1969  nuclease (SNase-like)  29.2 
 
 		 172 aa  41.6  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2736  Micrococcal nuclease  27.63 
 
 		 258 aa  41.2  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3956  nuclease (SNase-like)  29.2 
 
 		 171 aa  41.2  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5136  nuclease  34.18 
 
 		 273 aa  41.2  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2354  nuclease (SNase-like)  28.57 
 
 		 164 aa  40.8  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.527166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>