34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7541 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7541  hypothetical protein  100 
 
 		 240 aa  479  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0509  nuclease (SNase-like)  52.92 
 
 		 273 aa  231  6e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.58824  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0276  nuclease (SNase-like)  54.09 
 
 		 264 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.1811 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0551  nuclease (SNase-like)  50.21 
 
 		 258 aa  209  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0553  nuclease (SNase-like)  50.86 
 
 		 269 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.117842  normal  0.132209 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0453  nuclease  49.78 
 
 		 259 aa  202  5e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.686842 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0487  nuclease (SNase domain protein)  47.44 
 
 		 262 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.936462  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1691  nuclease  32.58 
 
 		 272 aa  110  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0880921 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3304  hypothetical protein  35.74 
 
 		 283 aa  100  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.293773 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3627  hypothetical protein  36.28 
 
 		 283 aa  99.4  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.782253  normal  0.3305 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5911  hypothetical protein  36.4 
 
 		 304 aa  92.4  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00689412  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3161  nuclease  32.78 
 
 		 284 aa  89.7  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.361815 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3504  hypothetical protein  36.62 
 
 		 286 aa  89.7  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.385885 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2232  SNase-like nuclease  30.22 
 
 		 289 aa  89.7  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00607458 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4491  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  38.04 
 
 		 274 aa  88.6  7e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0083  nuclease, SNase-like  35.93 
 
 		 274 aa  87.8  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2298  nuclease  30.81 
 
 		 309 aa  72  0.000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.195217  normal  0.652893 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5286  hypothetical protein  34.15 
 
 		 279 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1361  nuclease (SNase domain protein)  32.77 
 
 		 336 aa  68.6  0.00000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.048766 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2093  nuclease (SNase domain protein)  29.74 
 
 		 278 aa  62.8  0.000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00243596  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0402  nuclease (SNase-like)  28.24 
 
 		 260 aa  62  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2968  nuclease (SNase domain protein)  29.1 
 
 		 272 aa  61.2  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00021469  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04500  nuclease (SNase domain protein)  25.81 
 
 		 276 aa  59.3  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5135  staphylococcal nuclease-like protein  30.64 
 
 		 247 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3427  nuclease  24.68 
 
 		 263 aa  53.5  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.983203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4959  nuclease  27.83 
 
 		 273 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5086  nuclease (SNase domain protein)  26.79 
 
 		 255 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.715814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0379  nuclease  27.27 
 
 		 273 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5136  nuclease  27.36 
 
 		 273 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0538  nuclease  28.23 
 
 		 266 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66700  putative nuclease  31.13 
 
 		 255 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4927  nuclease (SNase domain protein)  35.03 
 
 		 200 aa  44.7  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5785  putative nuclease  30.28 
 
 		 255 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.397198  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1900  nuclease (SNase-like)  26.09 
 
 		 266 aa  44.3  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.898699  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>