21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4491 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4491  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  100 
 
 
274 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3627  hypothetical protein  58.13 
 
 
283 aa  246  4e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.782253  normal  0.3305 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3304  hypothetical protein  56.91 
 
 
283 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.293773 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3504  hypothetical protein  58.44 
 
 
286 aa  215  5e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.385885 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5911  hypothetical protein  53.69 
 
 
304 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00689412  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5286  hypothetical protein  52.69 
 
 
279 aa  156  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0551  nuclease (SNase-like)  40.91 
 
 
258 aa  89.7  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3161  nuclease  33.46 
 
 
284 aa  89.4  5e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.361815 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0553  nuclease (SNase-like)  41.56 
 
 
269 aa  89  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.117842  normal  0.132209 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7541  hypothetical protein  37.8 
 
 
240 aa  89  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0276  nuclease (SNase-like)  37.01 
 
 
264 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.1811 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0487  nuclease (SNase domain protein)  37.5 
 
 
262 aa  79  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.936462  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0453  nuclease  35.58 
 
 
259 aa  75.5  0.0000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.686842 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0509  nuclease (SNase-like)  35.98 
 
 
273 aa  70.9  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.58824  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1361  nuclease (SNase domain protein)  39.13 
 
 
336 aa  62.8  0.000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.048766 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0083  nuclease, SNase-like  36.42 
 
 
274 aa  62.4  0.000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2298  nuclease  36.16 
 
 
309 aa  59.3  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.195217  normal  0.652893 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1691  nuclease  30.61 
 
 
272 aa  53.5  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0880921 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2232  SNase-like nuclease  29.2 
 
 
289 aa  52.4  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00607458 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3427  nuclease  30 
 
 
263 aa  46.6  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.983203  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1900  nuclease (SNase-like)  25.74 
 
 
266 aa  44.3  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.898699  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>