24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3304 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3304  hypothetical protein  100 
 
 		 283 aa  535  1e-151  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.293773 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3627  hypothetical protein  95.76 
 
 		 283 aa  510  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.782253  normal  0.3305 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3504  hypothetical protein  78.82 
 
 		 286 aa  363  1e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.385885 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4491  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  56.91 
 
 		 274 aa  226  4e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5911  hypothetical protein  55.56 
 
 		 304 aa  204  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00689412  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5286  hypothetical protein  53.9 
 
 		 279 aa  185  8e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7541  hypothetical protein  34.8 
 
 		 240 aa  95.1  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3161  nuclease  30.17 
 
 		 284 aa  89.4  6e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.361815 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0551  nuclease (SNase-like)  33.19 
 
 		 258 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0276  nuclease (SNase-like)  36.93 
 
 		 264 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.1811 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1361  nuclease (SNase domain protein)  35.34 
 
 		 336 aa  79.3  0.00000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.048766 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0553  nuclease (SNase-like)  38.18 
 
 		 269 aa  79.3  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.117842  normal  0.132209 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1691  nuclease  30.16 
 
 		 272 aa  76.3  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0880921 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2232  SNase-like nuclease  33.64 
 
 		 289 aa  72  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00607458 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0509  nuclease (SNase-like)  29.81 
 
 		 273 aa  70.9  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.58824  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0487  nuclease (SNase domain protein)  35.27 
 
 		 262 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.936462  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0083  nuclease, SNase-like  35.06 
 
 		 274 aa  58.9  0.00000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1900  nuclease (SNase-like)  25.21 
 
 		 266 aa  56.2  0.0000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.898699  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0453  nuclease  28 
 
 		 259 aa  53.9  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.686842 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2298  nuclease  34.59 
 
 		 309 aa  52.4  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.195217  normal  0.652893 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66700  putative nuclease  28.65 
 
 		 255 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2093  nuclease (SNase domain protein)  25.1 
 
 		 278 aa  43.9  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00243596  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5785  putative nuclease  28.96 
 
 		 255 aa  42.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.397198  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3427  nuclease  29.6 
 
 		 263 aa  42.4  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.983203  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>