38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0453 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0453  nuclease  100 
 
 		 259 aa  518  1e-146  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.686842 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0509  nuclease (SNase-like)  71.72 
 
 		 273 aa  325  5e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.58824  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0551  nuclease (SNase-like)  51.34 
 
 		 258 aa  242  3e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0276  nuclease (SNase-like)  52.17 
 
 		 264 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.1811 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0553  nuclease (SNase-like)  50.91 
 
 		 269 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.117842  normal  0.132209 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7541  hypothetical protein  49.78 
 
 		 240 aa  209  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0487  nuclease (SNase domain protein)  50.65 
 
 		 262 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.936462  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1691  nuclease  31.87 
 
 		 272 aa  99.4  6e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0880921 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2232  SNase-like nuclease  31.6 
 
 		 289 aa  87.8  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00607458 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4491  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  35.58 
 
 		 274 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0083  nuclease, SNase-like  32.5 
 
 		 274 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5911  hypothetical protein  33.74 
 
 		 304 aa  75.5  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00689412  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0538  nuclease  32.11 
 
 		 266 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0402  nuclease (SNase-like)  29.05 
 
 		 260 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2298  nuclease  35.07 
 
 		 309 aa  72.4  0.000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.195217  normal  0.652893 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2093  nuclease (SNase domain protein)  29.63 
 
 		 278 aa  70.5  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00243596  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5135  staphylococcal nuclease-like protein  28.7 
 
 		 247 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04500  nuclease (SNase domain protein)  26.32 
 
 		 276 aa  68.2  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3161  nuclease  29.06 
 
 		 284 aa  67.8  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.361815 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5785  putative nuclease  30.88 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.397198  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4959  nuclease  28.08 
 
 		 273 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3304  hypothetical protein  28 
 
 		 283 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.293773 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0400  nuclease  28.96 
 
 		 267 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.246467  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5086  nuclease (SNase domain protein)  27.78 
 
 		 255 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.715814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66700  putative nuclease  29.22 
 
 		 255 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0379  nuclease  27.82 
 
 		 273 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3627  hypothetical protein  30 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.782253  normal  0.3305 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3427  nuclease  26.28 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.983203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1361  nuclease (SNase domain protein)  31.1 
 
 		 336 aa  58.5  0.00000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.048766 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5286  hypothetical protein  29.17 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  28.1 
 
 		 183 aa  55.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5136  nuclease  26.14 
 
 		 273 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1900  nuclease (SNase-like)  25.78 
 
 		 266 aa  52  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.898699  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3504  hypothetical protein  29.75 
 
 		 286 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.385885 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4124  nuclease  26.54 
 
 		 260 aa  48.5  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000792946  hitchhiker  0.000000518116 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2968  nuclease (SNase domain protein)  27.51 
 
 		 272 aa  46.6  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00021469  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0103  thermonuclease  32.26 
 
 		 209 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.244407  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0382  nuclease  28.79 
 
 		 256 aa  44.7  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>