19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1361 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1361  nuclease (SNase domain protein)  100 
 
 		 336 aa  655    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.048766 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3161  nuclease  48.26 
 
 		 284 aa  207  2e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.361815 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3627  hypothetical protein  36.21 
 
 		 283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.782253  normal  0.3305 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3304  hypothetical protein  35.34 
 
 		 283 aa  108  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.293773 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0276  nuclease (SNase-like)  36.91 
 
 		 264 aa  106  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.1811 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1691  nuclease  29.88 
 
 		 272 aa  97.4  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0880921 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4491  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  39.13 
 
 		 274 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3504  hypothetical protein  35.37 
 
 		 286 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.385885 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5911  hypothetical protein  29.79 
 
 		 304 aa  86.7  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00689412  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7541  hypothetical protein  32.77 
 
 		 240 aa  85.1  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2298  nuclease  34.1 
 
 		 309 aa  84.7  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.195217  normal  0.652893 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0553  nuclease (SNase-like)  35.04 
 
 		 269 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.117842  normal  0.132209 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0551  nuclease (SNase-like)  32.79 
 
 		 258 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2232  SNase-like nuclease  28.63 
 
 		 289 aa  68.6  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00607458 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0487  nuclease (SNase domain protein)  32.02 
 
 		 262 aa  67  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.936462  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0509  nuclease (SNase-like)  32.17 
 
 		 273 aa  66.6  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.58824  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0453  nuclease  31.74 
 
 		 259 aa  65.9  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.686842 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5286  hypothetical protein  36.63 
 
 		 279 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0083  nuclease, SNase-like  30.54 
 
 		 274 aa  48.1  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>