53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4671 on replicon NC_007961
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007961  Nham_4671  nuclease (SNase-like)  100 
 
 		 154 aa  309  1e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.91536  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4764  nuclease  62.42 
 
 		 196 aa  177  4e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00156339  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9184  nuclease protein  63.57 
 
 		 127 aa  162  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.779909  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8127  nuclease  58.09 
 
 		 146 aa  158  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.129752  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2972  nuclease  51.52 
 
 		 273 aa  136  7.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0557  nuclease (SNase-like)  56.64 
 
 		 143 aa  130  9e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.364333  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1966  putative transmembrane protein  48.33 
 
 		 252 aa  103  8e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.113674  normal  0.424222 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3090  nuclease (SNase-like)  42.69 
 
 		 201 aa  103  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.906098  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3627  hypothetical protein  41.54 
 
 		 241 aa  95.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3328  hypothetical protein  45.61 
 
 		 241 aa  94  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.291078 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0240  nuclease (SNase-like)  38.89 
 
 		 160 aa  83.2  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3139  nuclease (SNase-like)  41.35 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0817  nuclease (SNase-like)  38.83 
 
 		 182 aa  67  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.113561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3167  nuclease  41.58 
 
 		 122 aa  63.5  0.0000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0139898  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4945  nuclease  42.73 
 
 		 170 aa  61.2  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.377656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3964  nuclease  39 
 
 		 114 aa  53.9  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1554  nuclease (SNase-like)  33.33 
 
 		 202 aa  53.5  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1250  nuclease (SNase-like)  35.78 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3323  nuclease  40.43 
 
 		 163 aa  52.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.763522 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2567  nuclease  33.04 
 
 		 148 aa  51.6  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.190384 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2776  nuclease (SNase-like)  31.03 
 
 		 186 aa  51.2  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  40 
 
 		 214 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4496  nuclease  31.67 
 
 		 187 aa  47.8  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3427  nuclease  39.58 
 
 		 263 aa  47.8  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.983203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03631  hypothetical protein  32.69 
 
 		 155 aa  46.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1306  nuclease (SNase-like)  33.58 
 
 		 175 aa  46.6  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  32.67 
 
 		 178 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000025104  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1084  nuclease (SNase domain protein)  39.33 
 
 		 333 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.598507  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  31.25 
 
 		 169 aa  45.1  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4927  nuclease (SNase domain protein)  35.78 
 
 		 200 aa  44.7  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  32.29 
 
 		 171 aa  44.3  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1385  thermonuclease  33.33 
 
 		 190 aa  44.3  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000128794  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3319  SNase-like nuclease  34.78 
 
 		 158 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.135284 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1412  thermonuclease  33.33 
 
 		 190 aa  44.3  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000099778  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2093  nuclease (SNase domain protein)  39 
 
 		 278 aa  44.3  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00243596  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  37.89 
 
 		 162 aa  44.3  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  29.63 
 
 		 174 aa  43.9  0.0008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1969  nuclease (SNase-like)  34.04 
 
 		 172 aa  43.5  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3415  nuclease (SNase-like)  34.21 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  32.61 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1190  nuclease  28.57 
 
 		 166 aa  42.4  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0870678  normal  0.0174729 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0912  Micrococcal nuclease (thermonuclease)  36.59 
 
 		 190 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  35.29 
 
 		 214 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1371  nuclease  35.71 
 
 		 231 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.490456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  35.29 
 
 		 226 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0143  putative nuclease  35.64 
 
 		 193 aa  41.2  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  unclonable  0.000000000478675  hitchhiker  0.000499621 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2354  nuclease (SNase-like)  27.69 
 
 		 164 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.527166  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0832  micrococcal nuclease  30.85 
 
 		 228 aa  41.2  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000140573  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0371  nuclease  37.89 
 
 		 350 aa  41.2  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000121604  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0816  micrococcal nuclease  30.85 
 
 		 228 aa  41.2  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000405887  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1467  Excalibur domain-containing protein  28.83 
 
 		 259 aa  40.4  0.008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3956  nuclease (SNase-like)  32.98 
 
 		 171 aa  40.4  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1722  nuclease (SNase domain protein)  35 
 
 		 273 aa  40  0.01  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>