37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0557 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0557  nuclease (SNase-like)  100 
 
 		 143 aa  291  3e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.364333  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8127  nuclease  50.35 
 
 		 146 aa  133  9e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.129752  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4671  nuclease (SNase-like)  56.64 
 
 		 154 aa  130  6e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.91536  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4764  nuclease  51.15 
 
 		 196 aa  123  8.000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00156339  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9184  nuclease protein  50 
 
 		 127 aa  121  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.779909  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2972  nuclease  46.85 
 
 		 273 aa  110  9e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1966  putative transmembrane protein  42.4 
 
 		 252 aa  89  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.113674  normal  0.424222 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3090  nuclease (SNase-like)  43.65 
 
 		 201 aa  87.4  6e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.906098  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3328  hypothetical protein  37.24 
 
 		 241 aa  86.7  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.291078 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3627  hypothetical protein  40.16 
 
 		 241 aa  86.7  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0240  nuclease (SNase-like)  40.87 
 
 		 160 aa  80.1  0.000000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3139  nuclease (SNase-like)  36.62 
 
 		 158 aa  74.7  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0817  nuclease (SNase-like)  33.56 
 
 		 182 aa  72  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.113561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3167  nuclease  35.92 
 
 		 122 aa  58.5  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0139898  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1250  nuclease (SNase-like)  36.11 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0400  nuclease  37.93 
 
 		 267 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.246467  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  34.38 
 
 		 178 aa  48.9  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000025104  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5135  staphylococcal nuclease-like protein  39.36 
 
 		 247 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3956  nuclease (SNase-like)  35.79 
 
 		 171 aa  47.8  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  37.36 
 
 		 226 aa  47.4  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  37.36 
 
 		 214 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1969  nuclease (SNase-like)  33.68 
 
 		 172 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  36.26 
 
 		 214 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1554  nuclease (SNase-like)  35.16 
 
 		 202 aa  44.7  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3319  SNase-like nuclease  32.37 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.135284 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0753  nuclease  31.78 
 
 		 237 aa  43.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.838035  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0402  nuclease (SNase-like)  34.04 
 
 		 260 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2567  nuclease  29.61 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.190384 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0816  micrococcal nuclease  27.78 
 
 		 228 aa  41.6  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000405887  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1412  thermonuclease  31.65 
 
 		 190 aa  41.2  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000099778  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0832  micrococcal nuclease  27.78 
 
 		 228 aa  41.6  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000140573  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1385  thermonuclease  31.65 
 
 		 190 aa  41.2  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000128794  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4927  nuclease (SNase domain protein)  34.31 
 
 		 200 aa  40.8  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3634  nuclease (SNase domain protein)  34.74 
 
 		 382 aa  40.4  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.322659 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06071  micrococcal nuclease  33.33 
 
 		 185 aa  40.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.312315  normal  0.542138 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5158  hypothetical protein  32.5 
 
 		 147 aa  40  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.275699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3964  nuclease  31.68 
 
 		 114 aa  40  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>