20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5158 on replicon NC_010335
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010335  Caul_5158  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  294  3e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.275699  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3053  hypothetical protein  58.82 
 
 
146 aa  157  7e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3050  hypothetical protein  57.98 
 
 
137 aa  154  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.072649  normal  0.0989369 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3796  hypothetical protein  40.14 
 
 
139 aa  106  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000706753  unclonable  0.000000150422 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0791  hypothetical protein  45.93 
 
 
139 aa  106  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.540962 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3789  SNase-like nuclease  38.32 
 
 
131 aa  54.3  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0300901  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1306  nuclease (SNase-like)  33.03 
 
 
175 aa  51.6  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0791  nuclease (SNase-like)  34.83 
 
 
169 aa  48.9  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0873  nuclease (SNase-like)  32.71 
 
 
178 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  31.07 
 
 
148 aa  46.6  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4945  nuclease  33.33 
 
 
170 aa  45.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.377656  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  35.29 
 
 
169 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  23.31 
 
 
199 aa  41.6  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3167  nuclease  32.32 
 
 
122 aa  41.2  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0139898  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  31.52 
 
 
156 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25810  nuclease  34.44 
 
 
169 aa  41.6  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.823432  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  28.72 
 
 
153 aa  41.2  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1190  nuclease  33.72 
 
 
166 aa  41.2  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0870678  normal  0.0174729 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0952  nuclease (SNase-like)  31.94 
 
 
157 aa  40.8  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0557  nuclease (SNase-like)  32.5 
 
 
143 aa  40  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.364333  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>