52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4764 on replicon NC_009670
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009670  Oant_4764  nuclease  100 
 
 
196 aa  390  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00156339  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4671  nuclease (SNase-like)  62.42 
 
 
154 aa  177  8e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.91536  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9184  nuclease protein  65.04 
 
 
127 aa  157  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.779909  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8127  nuclease  61.24 
 
 
146 aa  152  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.129752  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2972  nuclease  55.17 
 
 
273 aa  128  5.0000000000000004e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0557  nuclease (SNase-like)  53.45 
 
 
143 aa  121  6e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.364333  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1966  putative transmembrane protein  49.51 
 
 
252 aa  102  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.113674  normal  0.424222 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3627  hypothetical protein  42.11 
 
 
241 aa  93.2  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3328  hypothetical protein  42.11 
 
 
241 aa  92.4  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.291078 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3090  nuclease (SNase-like)  48.6 
 
 
201 aa  87.8  9e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.906098  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0240  nuclease (SNase-like)  38.4 
 
 
160 aa  73.6  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3167  nuclease  37.4 
 
 
122 aa  68.2  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0139898  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3139  nuclease (SNase-like)  37.86 
 
 
158 aa  65.9  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0817  nuclease (SNase-like)  38.24 
 
 
182 aa  65.5  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.113561  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4945  nuclease  43.4 
 
 
170 aa  62.8  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.377656  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1250  nuclease (SNase-like)  35.78 
 
 
124 aa  57.4  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3964  nuclease  39 
 
 
114 aa  56.6  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5136  nuclease  39.36 
 
 
273 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1554  nuclease (SNase-like)  35.16 
 
 
202 aa  49.3  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4927  nuclease (SNase domain protein)  38.78 
 
 
200 aa  48.9  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1084  nuclease (SNase domain protein)  37.63 
 
 
333 aa  48.5  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.598507  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3427  nuclease  38.95 
 
 
263 aa  47  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.983203  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0379  nuclease  40.43 
 
 
273 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5373  putative nuclease-like protein  38 
 
 
176 aa  45.8  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0199446 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0912  Micrococcal nuclease (thermonuclease)  37.5 
 
 
190 aa  45.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2093  nuclease (SNase domain protein)  39.18 
 
 
278 aa  45.1  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00243596  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4124  nuclease  38.04 
 
 
260 aa  45.1  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000792946  hitchhiker  0.000000518116 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5086  nuclease (SNase domain protein)  38.3 
 
 
255 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.715814  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2776  nuclease (SNase-like)  30.19 
 
 
186 aa  45.1  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  35.11 
 
 
178 aa  44.7  0.0008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000025104  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4959  nuclease  38.3 
 
 
273 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1412  thermonuclease  34.34 
 
 
190 aa  43.9  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000099778  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1385  thermonuclease  34.34 
 
 
190 aa  43.9  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000128794  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3415  nuclease (SNase-like)  29.53 
 
 
146 aa  43.9  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0402  nuclease (SNase-like)  34.78 
 
 
260 aa  44.3  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  36.67 
 
 
214 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1330  nuclease  38.94 
 
 
159 aa  43.1  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000000142245 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2567  nuclease  29.73 
 
 
148 aa  42.7  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.190384 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3323  nuclease  36.17 
 
 
163 aa  43.1  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.763522 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4496  nuclease  31.9 
 
 
187 aa  42.7  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00761  hypothetical protein  35.51 
 
 
155 aa  42.4  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.489486 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1306  nuclease (SNase-like)  35.51 
 
 
175 aa  42.4  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0832  micrococcal nuclease  30.85 
 
 
228 aa  42  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000140573  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0816  micrococcal nuclease  30.85 
 
 
228 aa  42  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000405887  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03631  hypothetical protein  33.33 
 
 
155 aa  42.4  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1889  nuclease (SNase domain protein)  36.36 
 
 
224 aa  42.4  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.058729  normal  0.0179002 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1371  nuclease  30.56 
 
 
231 aa  41.6  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.490456  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66700  putative nuclease  38.46 
 
 
255 aa  41.6  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3744  nuclease  32.63 
 
 
161 aa  41.2  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0374  nuclease  29.76 
 
 
346 aa  41.2  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.180384  hitchhiker  0.00530121 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04500  nuclease (SNase domain protein)  34.78 
 
 
276 aa  41.2  0.01  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1218  micrococcal nuclease  35.56 
 
 
284 aa  41.2  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340298  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>