56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1330 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1330  nuclease  100 
 
 		 159 aa  312  9e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000142245 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3415  nuclease (SNase-like)  45.16 
 
 		 146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0029  nuclease (SNase-like)  46.43 
 
 		 196 aa  100  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.139234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0715  nuclease (SNase-like)  46.43 
 
 		 193 aa  94.4  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.680905 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0154  nuclease  45.61 
 
 		 190 aa  93.2  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0088  SNase-like nuclease  44.64 
 
 		 192 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3035  nuclease (SNase-like)  38.62 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.376528  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0580  nuclease (SNase-like)  42.62 
 
 		 168 aa  74.7  0.0000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2567  nuclease  34.81 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.190384 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0033  nuclease (SNase domain protein)  41.07 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2354  nuclease (SNase-like)  38.85 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.527166  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3167  nuclease  41.96 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0139898  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1025  nuclease  38.66 
 
 		 189 aa  57.4  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0861238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3090  nuclease (SNase-like)  35.9 
 
 		 201 aa  57.8  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.906098  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0873  nuclease (SNase domain protein)  39.17 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.485227 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  28.78 
 
 		 164 aa  52.8  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4764  nuclease  38.94 
 
 		 196 aa  50.8  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00156339  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1218  micrococcal nuclease  34.17 
 
 		 284 aa  50.8  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340298  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1554  nuclease (SNase-like)  36.54 
 
 		 202 aa  48.5  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  29.55 
 
 		 156 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0480  nuclease  38.38 
 
 		 136 aa  47.4  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.898976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0402  nuclease (SNase-like)  36.09 
 
 		 260 aa  47  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00761  hypothetical protein  28.79 
 
 		 155 aa  47  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.489486 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0447  nuclease (SNase-like)  33.04 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0276095  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2807  nuclease (SNase-like)  31.9 
 
 		 178 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00150481  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06071  micrococcal nuclease  39.18 
 
 		 185 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.312315  normal  0.542138 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8127  nuclease  31.43 
 
 		 146 aa  45.8  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.129752  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1627  nuclease (SNase domain protein)  34.62 
 
 		 221 aa  45.1  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.839518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1261  nuclease (SNase domain protein)  35.16 
 
 		 301 aa  44.7  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0400  nuclease  31.58 
 
 		 267 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.246467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1889  nuclease (SNase domain protein)  36.11 
 
 		 224 aa  44.3  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.058729  normal  0.0179002 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0781  nuclease (SNase-like)  44.74 
 
 		 114 aa  44.3  0.0007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0368621  normal  0.0365666 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0779  nuclease (SNase domain protein)  30.43 
 
 		 169 aa  43.9  0.0008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2515  nuclease (SNase domain protein)  34.62 
 
 		 221 aa  43.9  0.0009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.893874 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2776  nuclease (SNase-like)  31.91 
 
 		 186 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  26.72 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  27.59 
 
 		 153 aa  43.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4496  nuclease  31.16 
 
 		 187 aa  42.4  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5136  nuclease  33.83 
 
 		 273 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  28.8 
 
 		 175 aa  43.1  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  28 
 
 		 175 aa  42.4  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  28 
 
 		 175 aa  42.7  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1118  nuclease (SNase domain protein)  32.86 
 
 		 180 aa  42  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2219  nuclease (SNase domain protein)  40.51 
 
 		 205 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1682  nuclease (SNase-like)  36.27 
 
 		 153 aa  42.4  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0199869  normal  0.0644244 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0290  SNase-like nuclease  30 
 
 		 227 aa  42.4  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0111  nuclease  35.59 
 
 		 227 aa  41.6  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0317  nuclease (SNase domain protein)  35.59 
 
 		 227 aa  41.6  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183306  normal  0.136686 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2456  nuclease (SNase domain protein)  34.44 
 
 		 240 aa  42  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.127297  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2051  nuclease (SNase-like)  34.17 
 
 		 228 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0268547  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08950  nuclease  33.93 
 
 		 208 aa  41.6  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870151  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  35.71 
 
 		 178 aa  41.2  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000025104  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1084  nuclease (SNase domain protein)  33.04 
 
 		 333 aa  41.2  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.598507  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3662  nuclease (SNase domain protein)  33.33 
 
 		 175 aa  40.8  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.808999  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  28.15 
 
 		 174 aa  40.8  0.007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  35.14 
 
 		 214 aa  40.4  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>