88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2354 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2354  nuclease (SNase-like)  100 
 
 		 164 aa  322  1e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.527166  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2807  nuclease (SNase-like)  50 
 
 		 178 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00150481  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1025  nuclease  48.28 
 
 		 189 aa  106  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0861238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0873  nuclease (SNase domain protein)  49.12 
 
 		 146 aa  105  3e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.485227 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2567  nuclease  39.81 
 
 		 148 aa  82.8  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.190384 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3035  nuclease (SNase-like)  36 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.376528  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1381  micrococcal nuclease-like protein  46.97 
 
 		 88 aa  61.2  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0429202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  29.57 
 
 		 153 aa  57  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3415  nuclease (SNase-like)  34.13 
 
 		 146 aa  57  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3090  nuclease (SNase-like)  29.69 
 
 		 201 aa  52  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.906098  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2736  Micrococcal nuclease  29.85 
 
 		 258 aa  51.6  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8127  nuclease  29.71 
 
 		 146 aa  51.2  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.129752  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0753  nuclease  37.35 
 
 		 237 aa  50.8  0.000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.838035  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1330  nuclease  40.52 
 
 		 159 aa  50.8  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000142245 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1218  micrococcal nuclease  34.62 
 
 		 284 aa  50.4  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340298  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0029  nuclease (SNase-like)  34.26 
 
 		 196 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.139234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5232  nuclease (SNase domain protein)  35.25 
 
 		 175 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  29.27 
 
 		 238 aa  49.7  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0154  nuclease  35.45 
 
 		 190 aa  49.7  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3956  nuclease (SNase-like)  35.92 
 
 		 171 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0240  nuclease (SNase-like)  32.33 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1554  nuclease (SNase-like)  29.52 
 
 		 202 aa  48.9  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3323  nuclease  36.89 
 
 		 163 aa  48.9  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.763522 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1306  nuclease (SNase-like)  36.73 
 
 		 175 aa  48.9  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1412  thermonuclease  28.8 
 
 		 190 aa  48.5  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000099778  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  25.96 
 
 		 148 aa  48.5  0.00004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1385  thermonuclease  28.8 
 
 		 190 aa  48.5  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000128794  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2501  nuclease  34.31 
 
 		 205 aa  48.1  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.080015  normal  0.0413796 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  29.92 
 
 		 178 aa  48.1  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000025104  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0088  SNase-like nuclease  35.19 
 
 		 192 aa  48.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3167  nuclease  30.19 
 
 		 122 aa  47.8  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0139898  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1969  nuclease (SNase-like)  32.04 
 
 		 172 aa  47.8  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1359  nuclease (SNase domain protein)  34.21 
 
 		 191 aa  47.8  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104697  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  27.52 
 
 		 206 aa  47.4  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4945  nuclease  35.11 
 
 		 170 aa  47  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.377656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  27.88 
 
 		 175 aa  47  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  29.63 
 
 		 156 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  31.9 
 
 		 214 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  27.59 
 
 		 174 aa  46.6  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0374  nuclease  34.94 
 
 		 346 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.180384  hitchhiker  0.00530121 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3653  nuclease (SNase domain protein)  26.95 
 
 		 171 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3707  nuclease (SNase domain protein)  26.95 
 
 		 171 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.112464  normal  0.156975 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  26.92 
 
 		 175 aa  46.2  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  26.92 
 
 		 175 aa  46.2  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0557  nuclease (SNase-like)  30.15 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.364333  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0715  nuclease (SNase-like)  34.26 
 
 		 193 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.680905 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2776  nuclease (SNase-like)  31.69 
 
 		 186 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  29.81 
 
 		 227 aa  45.4  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  30.39 
 
 		 161 aa  45.8  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06071  micrococcal nuclease  31.46 
 
 		 185 aa  45.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.312315  normal  0.542138 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2357  nuclease  25.58 
 
 		 221 aa  44.7  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0156  nuclease (SNase-like)  28 
 
 		 228 aa  44.7  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216151  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  32.04 
 
 		 226 aa  45.1  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1682  nuclease (SNase-like)  33.66 
 
 		 153 aa  44.7  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0199869  normal  0.0644244 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02380  micrococcal nuclease-like nuclease  34.95 
 
 		 408 aa  44.7  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03631  hypothetical protein  33.06 
 
 		 155 aa  44.7  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0873  nuclease (SNase-like)  28.57 
 
 		 178 aa  44.3  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0952  nuclease (SNase-like)  30 
 
 		 157 aa  43.9  0.0009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0290  SNase-like nuclease  32.26 
 
 		 227 aa  43.9  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0454  nuclease (SNase domain protein)  25.53 
 
 		 192 aa  43.5  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  31.53 
 
 		 164 aa  43.5  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1199  nuclease, putative  26.89 
 
 		 187 aa  42.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000552466  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  24.59 
 
 		 180 aa  43.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_004310  BR0870  nuclease domain-containing protein  25.93 
 
 		 189 aa  43.1  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2942  prophage MuMc02, nuclease, putative  29.81 
 
 		 216 aa  43.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0862  nuclease domain-containing protein  25.93 
 
 		 189 aa  43.1  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4496  nuclease  32.26 
 
 		 187 aa  42.4  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  25.69 
 
 		 179 aa  42.4  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  28.97 
 
 		 199 aa  42.4  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  27.21 
 
 		 166 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0580  nuclease (SNase-like)  28.12 
 
 		 168 aa  42.4  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  32.52 
 
 		 162 aa  41.6  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4688  nuclease (SNase-like)  33.33 
 
 		 241 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0791  hypothetical protein  31.47 
 
 		 139 aa  41.6  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.540962 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1371  nuclease  34.65 
 
 		 231 aa  41.2  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.490456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1472  nuclease  25 
 
 		 183 aa  41.2  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0791  nuclease (SNase-like)  30.19 
 
 		 169 aa  41.2  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4671  nuclease (SNase-like)  27.69 
 
 		 154 aa  40.8  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.91536  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1912  nuclease (SNase-like)  33.33 
 
 		 323 aa  40.8  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183465  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0389  nuclease  25 
 
 		 183 aa  41.2  0.007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1889  nuclease (SNase domain protein)  31.48 
 
 		 224 aa  40.8  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.058729  normal  0.0179002 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1570  nuclease family protein  27.72 
 
 		 115 aa  40.8  0.008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.30531  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4124  nuclease  35.19 
 
 		 260 aa  40.8  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000792946  hitchhiker  0.000000518116 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2046  nuclease (SNase-like)  26.61 
 
 		 233 aa  40.8  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.484882 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3744  nuclease  27.21 
 
 		 161 aa  40.8  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9251  predicted protein  28.57 
 
 		 164 aa  40.8  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2340  nuclease (SNase domain protein)  30.77 
 
 		 162 aa  40.8  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1627  nuclease (SNase domain protein)  28.3 
 
 		 221 aa  40.4  0.01  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.839518  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>