24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0580 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0580  nuclease (SNase-like)  100 
 
 
168 aa  338  2e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0088  SNase-like nuclease  42.61 
 
 
192 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0029  nuclease (SNase-like)  47.31 
 
 
196 aa  74.3  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.139234  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0715  nuclease (SNase-like)  42.61 
 
 
193 aa  73.2  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.680905 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0154  nuclease  38.89 
 
 
190 aa  72.4  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3415  nuclease (SNase-like)  44.71 
 
 
146 aa  71.6  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1330  nuclease  42.02 
 
 
159 aa  66.2  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000000142245 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0033  nuclease (SNase domain protein)  46.81 
 
 
191 aa  61.6  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2807  nuclease (SNase-like)  28.37 
 
 
178 aa  55.1  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00150481  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3035  nuclease (SNase-like)  34.46 
 
 
143 aa  51.6  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.376528  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0873  nuclease (SNase domain protein)  35.45 
 
 
146 aa  49.7  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.485227 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3707  nuclease (SNase domain protein)  25 
 
 
171 aa  47.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.112464  normal  0.156975 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3653  nuclease (SNase domain protein)  25 
 
 
171 aa  47.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2567  nuclease  29.2 
 
 
148 aa  47.8  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.190384 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0447  nuclease (SNase-like)  24.6 
 
 
157 aa  45.8  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0276095  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0290  SNase-like nuclease  31.78 
 
 
227 aa  45.1  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  30.6 
 
 
206 aa  43.5  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2354  nuclease (SNase-like)  28.12 
 
 
164 aa  42.4  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.527166  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0658  nuclease (SNase domain protein)  38.78 
 
 
171 aa  42.4  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688137  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1025  nuclease  35.71 
 
 
189 aa  42  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0861238  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1250  nuclease (SNase-like)  29.51 
 
 
124 aa  41.6  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0569  nuclease  20.29 
 
 
192 aa  41.6  0.005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  37.96 
 
 
162 aa  41.6  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0400  nuclease  31.62 
 
 
267 aa  41.2  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.246467  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>