30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0033 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0033  nuclease (SNase domain protein)  100 
 
 		 191 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0715  nuclease (SNase-like)  78.87 
 
 		 193 aa  305  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.680905 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0088  SNase-like nuclease  79.38 
 
 		 192 aa  300  8.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0029  nuclease (SNase-like)  70.56 
 
 		 196 aa  272  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.139234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0154  nuclease  53.09 
 
 		 190 aa  180  1e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3415  nuclease (SNase-like)  44.25 
 
 		 146 aa  100  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1330  nuclease  41.07 
 
 		 159 aa  83.6  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000142245 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0580  nuclease (SNase-like)  40.87 
 
 		 168 aa  73.9  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3035  nuclease (SNase-like)  36.67 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.376528  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2567  nuclease  33.04 
 
 		 148 aa  62  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.190384 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3090  nuclease (SNase-like)  31.93 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.906098  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2354  nuclease (SNase-like)  36.36 
 
 		 164 aa  50.4  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.527166  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2807  nuclease (SNase-like)  33.65 
 
 		 178 aa  49.3  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00150481  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0848  nuclease-like protein  30.84 
 
 		 184 aa  48.9  0.00005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0898613  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  31.09 
 
 		 185 aa  48.5  0.00006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3167  nuclease  32.71 
 
 		 122 aa  48.1  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0139898  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  34.34 
 
 		 175 aa  47  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  34.34 
 
 		 175 aa  47  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  34.34 
 
 		 175 aa  47  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3323  nuclease  38.1 
 
 		 163 aa  46.2  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.763522 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1381  micrococcal nuclease-like protein  40.24 
 
 		 88 aa  44.7  0.0009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0429202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0658  nuclease (SNase domain protein)  30.97 
 
 		 171 aa  43.9  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688137  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1554  nuclease (SNase-like)  31.25 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  30.16 
 
 		 199 aa  42.7  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4945  nuclease  31.54 
 
 		 170 aa  42.7  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.377656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0862  nuclease domain-containing protein  29.51 
 
 		 189 aa  42.7  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2972  nuclease  33.33 
 
 		 273 aa  42.7  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0870  nuclease domain-containing protein  29.51 
 
 		 189 aa  42.7  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03631  hypothetical protein  32.08 
 
 		 155 aa  42  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3744  nuclease  32.69 
 
 		 161 aa  41.2  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>