43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2972 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2972  nuclease  100 
 
 		 273 aa  553  1e-156  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4671  nuclease (SNase-like)  51.52 
 
 		 154 aa  137  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.91536  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4764  nuclease  55.17 
 
 		 196 aa  128  8.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00156339  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1966  putative transmembrane protein  36.25 
 
 		 252 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.113674  normal  0.424222 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3328  hypothetical protein  33.08 
 
 		 241 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.291078 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8127  nuclease  50.43 
 
 		 146 aa  120  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.129752  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9184  nuclease protein  53.45 
 
 		 127 aa  118  9e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.779909  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3627  hypothetical protein  31.13 
 
 		 241 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0557  nuclease (SNase-like)  48.76 
 
 		 143 aa  107  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.364333  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3090  nuclease (SNase-like)  49.51 
 
 		 201 aa  89  8e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.906098  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3167  nuclease  38.46 
 
 		 122 aa  72.4  0.000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0139898  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0240  nuclease (SNase-like)  34.23 
 
 		 160 aa  67.4  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4945  nuclease  41.9 
 
 		 170 aa  65.9  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.377656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3139  nuclease (SNase-like)  27.34 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1250  nuclease (SNase-like)  36.36 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3964  nuclease  37.62 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3319  SNase-like nuclease  32.35 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.135284 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0817  nuclease (SNase-like)  28.57 
 
 		 182 aa  54.7  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.113561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2576  nuclease (SNase domain protein)  38.2 
 
 		 358 aa  52.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.901293  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3956  nuclease (SNase-like)  35.42 
 
 		 171 aa  48.1  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5136  nuclease  41.3 
 
 		 273 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0065  nuclease  37.36 
 
 		 227 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1554  nuclease (SNase-like)  36.67 
 
 		 202 aa  47  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0317  nuclease (SNase domain protein)  36.26 
 
 		 227 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183306  normal  0.136686 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0111  nuclease  36.26 
 
 		 227 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1306  nuclease (SNase-like)  33.94 
 
 		 175 aa  45.8  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  32.38 
 
 		 174 aa  45.8  0.0008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5086  nuclease (SNase domain protein)  39.13 
 
 		 255 aa  45.4  0.0009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.715814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4959  nuclease  39.13 
 
 		 273 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3323  nuclease  35.79 
 
 		 163 aa  45.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.763522 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5135  staphylococcal nuclease-like protein  39.13 
 
 		 247 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  37.36 
 
 		 214 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1969  nuclease (SNase-like)  32.32 
 
 		 172 aa  44.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0088  SNase-like nuclease  33.93 
 
 		 192 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3035  nuclease (SNase-like)  30.63 
 
 		 143 aa  44.3  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.376528  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0873  nuclease (SNase-like)  38.78 
 
 		 178 aa  43.5  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0154  nuclease  32.43 
 
 		 190 aa  43.5  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  30.11 
 
 		 192 aa  43.5  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1591  nuclease (SNase-like)  31.52 
 
 		 158 aa  43.1  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  37.96 
 
 		 162 aa  43.1  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  33.71 
 
 		 226 aa  42.7  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  33.71 
 
 		 214 aa  42.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3427  nuclease  36.17 
 
 		 263 aa  42  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.983203  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>