19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1381 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1381  micrococcal nuclease-like protein  100 
 
 		 88 aa  178  2e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0429202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2567  nuclease  46.05 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.190384 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2807  nuclease (SNase-like)  46.75 
 
 		 178 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00150481  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2354  nuclease (SNase-like)  46.97 
 
 		 164 aa  61.2  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.527166  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0873  nuclease (SNase domain protein)  44.29 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.485227 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1025  nuclease  45.45 
 
 		 189 aa  51.6  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0861238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3090  nuclease (SNase-like)  39.74 
 
 		 201 aa  50.4  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.906098  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0240  nuclease (SNase-like)  42.25 
 
 		 160 aa  50.4  0.000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0154  nuclease  40.24 
 
 		 190 aa  47  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3415  nuclease (SNase-like)  36.59 
 
 		 146 aa  47  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3167  nuclease  30.95 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0139898  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2776  nuclease (SNase-like)  42.25 
 
 		 186 aa  43.9  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4945  nuclease  41.33 
 
 		 170 aa  42.7  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.377656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1250  nuclease (SNase-like)  38.96 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3035  nuclease (SNase-like)  34.62 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.376528  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3653  nuclease (SNase domain protein)  35.14 
 
 		 171 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3707  nuclease (SNase domain protein)  35.14 
 
 		 171 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.112464  normal  0.156975 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2972  nuclease  35.9 
 
 		 273 aa  41.2  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4764  nuclease  36 
 
 		 196 aa  40.4  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00156339  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>