30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0154 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0154  nuclease  100 
 
 		 190 aa  380  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0029  nuclease (SNase-like)  60.51 
 
 		 196 aa  224  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.139234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0715  nuclease (SNase-like)  57.14 
 
 		 193 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.680905 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0088  SNase-like nuclease  58.86 
 
 		 192 aa  203  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0033  nuclease (SNase domain protein)  53.61 
 
 		 191 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3415  nuclease (SNase-like)  44.44 
 
 		 146 aa  102  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1330  nuclease  43.22 
 
 		 159 aa  89  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000142245 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3035  nuclease (SNase-like)  41.18 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.376528  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0580  nuclease (SNase-like)  38.89 
 
 		 168 aa  72  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2567  nuclease  27.94 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.190384 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3090  nuclease (SNase-like)  35.96 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.906098  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3167  nuclease  38.18 
 
 		 122 aa  52  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0139898  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2807  nuclease (SNase-like)  33.94 
 
 		 178 aa  51.6  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00150481  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2354  nuclease (SNase-like)  35.45 
 
 		 164 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.527166  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  33.05 
 
 		 164 aa  48.9  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0658  nuclease (SNase domain protein)  30 
 
 		 171 aa  46.6  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688137  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0873  nuclease (SNase domain protein)  31.71 
 
 		 146 aa  47  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.485227 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  31.5 
 
 		 156 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1025  nuclease  34.82 
 
 		 189 aa  47  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0861238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1381  micrococcal nuclease-like protein  40.24 
 
 		 88 aa  47  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0429202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3744  nuclease  34.62 
 
 		 161 aa  45.4  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0400  nuclease  34.4 
 
 		 267 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.246467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  37.86 
 
 		 226 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2972  nuclease  32.43 
 
 		 273 aa  44.3  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0240  nuclease (SNase-like)  35.4 
 
 		 160 aa  44.3  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  37.86 
 
 		 214 aa  43.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0065  nuclease  36.89 
 
 		 227 aa  43.1  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0402  nuclease (SNase-like)  32.52 
 
 		 260 aa  42  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  36.89 
 
 		 214 aa  42  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0317  nuclease (SNase domain protein)  34.31 
 
 		 227 aa  41.2  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183306  normal  0.136686 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>