50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0240 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_0240  nuclease (SNase-like)  100 
 
 		 160 aa  324  3e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0817  nuclease (SNase-like)  45.12 
 
 		 182 aa  124  6e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.113561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3139  nuclease (SNase-like)  41.46 
 
 		 158 aa  118  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8127  nuclease  39.04 
 
 		 146 aa  87.4  8e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.129752  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4671  nuclease (SNase-like)  38.89 
 
 		 154 aa  83.6  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.91536  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0557  nuclease (SNase-like)  40.87 
 
 		 143 aa  79.7  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.364333  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3090  nuclease (SNase-like)  39.2 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.906098  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4764  nuclease  40.54 
 
 		 196 aa  73.6  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00156339  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9184  nuclease protein  40 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.779909  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2972  nuclease  34.23 
 
 		 273 aa  67.4  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3167  nuclease  42.31 
 
 		 122 aa  63.5  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0139898  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3627  hypothetical protein  34.82 
 
 		 241 aa  58.5  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3328  hypothetical protein  33.93 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.291078 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  43.75 
 
 		 214 aa  54.7  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2354  nuclease (SNase-like)  33.12 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.527166  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3956  nuclease (SNase-like)  35.4 
 
 		 171 aa  51.6  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1969  nuclease (SNase-like)  37.89 
 
 		 172 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3744  nuclease  33.59 
 
 		 161 aa  50.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1250  nuclease (SNase-like)  39.45 
 
 		 124 aa  50.4  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1381  micrococcal nuclease-like protein  42.25 
 
 		 88 aa  50.4  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0429202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0832  micrococcal nuclease  35.48 
 
 		 228 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000140573  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3319  SNase-like nuclease  38.32 
 
 		 158 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.135284 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0816  micrococcal nuclease  35.48 
 
 		 228 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000405887  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1591  nuclease (SNase-like)  36.72 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1966  putative transmembrane protein  35.51 
 
 		 252 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.113674  normal  0.424222 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4945  nuclease  35.45 
 
 		 170 aa  49.3  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.377656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0873  nuclease (SNase-like)  30.77 
 
 		 178 aa  47.8  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  39.78 
 
 		 214 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1084  nuclease (SNase domain protein)  34.95 
 
 		 333 aa  47  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.598507  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3964  nuclease  36.36 
 
 		 114 aa  46.2  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3427  nuclease  32.45 
 
 		 263 aa  46.2  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.983203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  38.71 
 
 		 226 aa  45.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04500  nuclease (SNase domain protein)  31.88 
 
 		 276 aa  44.3  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0134  Excalibur  31.18 
 
 		 220 aa  43.5  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.194412  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3035  nuclease (SNase-like)  35.45 
 
 		 143 aa  43.9  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.376528  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1889  nuclease (SNase domain protein)  35.71 
 
 		 224 aa  43.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.058729  normal  0.0179002 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0154  nuclease  35.4 
 
 		 190 aa  43.9  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3323  nuclease  36.08 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.763522 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2736  Micrococcal nuclease  30.2 
 
 		 258 aa  42  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1261  nuclease (SNase domain protein)  34.59 
 
 		 301 aa  42  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0873  nuclease (SNase domain protein)  30.43 
 
 		 146 aa  42  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.485227 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1306  nuclease (SNase-like)  32.67 
 
 		 175 aa  42  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2567  nuclease  31.3 
 
 		 148 aa  41.6  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.190384 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  30 
 
 		 206 aa  40.8  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0088  SNase-like nuclease  34.21 
 
 		 192 aa  40.8  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4496  nuclease  26.32 
 
 		 187 aa  40.8  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3415  nuclease (SNase-like)  28.87 
 
 		 146 aa  40.8  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  30.28 
 
 		 174 aa  40.4  0.01  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2377  SNase-like nuclease  34.62 
 
 		 185 aa  40.4  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0106322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0065  nuclease  27.48 
 
 		 227 aa  40.4  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>