23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0817 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0817  nuclease (SNase-like)  100 
 
 
182 aa  374  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.113561  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3139  nuclease (SNase-like)  81.53 
 
 
158 aa  262  2e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0240  nuclease (SNase-like)  48.82 
 
 
160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0557  nuclease (SNase-like)  36.36 
 
 
143 aa  70.1  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.364333  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3090  nuclease (SNase-like)  41.18 
 
 
201 aa  70.1  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.906098  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8127  nuclease  39.22 
 
 
146 aa  69.3  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.129752  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4671  nuclease (SNase-like)  38.83 
 
 
154 aa  67  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.91536  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4764  nuclease  38.24 
 
 
196 aa  65.5  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00156339  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9184  nuclease protein  37.11 
 
 
127 aa  62  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.779909  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1966  putative transmembrane protein  33.96 
 
 
252 aa  58.5  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.113674  normal  0.424222 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3167  nuclease  35.29 
 
 
122 aa  55.1  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0139898  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4945  nuclease  33.33 
 
 
170 aa  55.1  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.377656  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2972  nuclease  29.13 
 
 
273 aa  54.7  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3328  hypothetical protein  32.04 
 
 
241 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.291078 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3627  hypothetical protein  31.07 
 
 
241 aa  48.9  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1250  nuclease (SNase-like)  36.67 
 
 
124 aa  48.5  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3956  nuclease (SNase-like)  30.53 
 
 
171 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1591  nuclease (SNase-like)  30.63 
 
 
158 aa  46.6  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1969  nuclease (SNase-like)  29.47 
 
 
172 aa  44.7  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1554  nuclease (SNase-like)  29.17 
 
 
202 aa  43.5  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3964  nuclease  32.99 
 
 
114 aa  43.1  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2052  succinoglycan biosynthesis protein  28.57 
 
 
171 aa  42.4  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132309  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3319  SNase-like nuclease  34.65 
 
 
158 aa  40.8  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.135284 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>