14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3627 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3627  hypothetical protein  100 
 
 		 241 aa  480  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3328  hypothetical protein  89.21 
 
 		 241 aa  434  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.291078 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9184  nuclease protein  48.65 
 
 		 127 aa  107  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.779909  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2972  nuclease  31.01 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1966  putative transmembrane protein  32.22 
 
 		 252 aa  102  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.113674  normal  0.424222 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8127  nuclease  43.75 
 
 		 146 aa  100  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.129752  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4671  nuclease (SNase-like)  41.54 
 
 		 154 aa  95.1  8e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.91536  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4764  nuclease  42.11 
 
 		 196 aa  93.2  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00156339  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0557  nuclease (SNase-like)  40.16 
 
 		 143 aa  86.3  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.364333  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0240  nuclease (SNase-like)  34.82 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3090  nuclease (SNase-like)  36.45 
 
 		 201 aa  58.2  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.906098  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0817  nuclease (SNase-like)  31.07 
 
 		 182 aa  48.9  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.113561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3139  nuclease (SNase-like)  30.39 
 
 		 158 aa  46.6  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4945  nuclease  29.25 
 
 		 170 aa  44.3  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.377656  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>