32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9184 on replicon NC_011984
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011984  Avi_9184  nuclease protein  100 
 
 		 127 aa  257  4e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.779909  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4671  nuclease (SNase-like)  63.57 
 
 		 154 aa  162  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.91536  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4764  nuclease  65.04 
 
 		 196 aa  157  6e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00156339  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8127  nuclease  63.71 
 
 		 146 aa  150  5.9999999999999996e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.129752  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0557  nuclease (SNase-like)  50 
 
 		 143 aa  121  4e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.364333  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2972  nuclease  53.45 
 
 		 273 aa  118  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3627  hypothetical protein  48.65 
 
 		 241 aa  107  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3328  hypothetical protein  49.55 
 
 		 241 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.291078 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1966  putative transmembrane protein  46.85 
 
 		 252 aa  93.6  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.113674  normal  0.424222 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3090  nuclease (SNase-like)  51.06 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.906098  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0240  nuclease (SNase-like)  42 
 
 		 160 aa  68.2  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0817  nuclease (SNase-like)  37.11 
 
 		 182 aa  62  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.113561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3139  nuclease (SNase-like)  38.78 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4945  nuclease  41.3 
 
 		 170 aa  54.7  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.377656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1250  nuclease (SNase-like)  35.78 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3964  nuclease  38.38 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3167  nuclease  35.58 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0139898  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1554  nuclease (SNase-like)  36.26 
 
 		 202 aa  48.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3323  nuclease  38.2 
 
 		 163 aa  48.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.763522 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4927  nuclease (SNase domain protein)  39 
 
 		 200 aa  45.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1722  nuclease (SNase domain protein)  36.08 
 
 		 273 aa  45.1  0.0004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0912  Micrococcal nuclease (thermonuclease)  35.42 
 
 		 190 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3427  nuclease  38.54 
 
 		 263 aa  43.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.983203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2093  nuclease (SNase domain protein)  35.05 
 
 		 278 aa  42.7  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00243596  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  36.96 
 
 		 214 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  33 
 
 		 162 aa  40.8  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2776  nuclease (SNase-like)  31.73 
 
 		 186 aa  40.8  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4496  nuclease  30.77 
 
 		 187 aa  40.8  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1371  nuclease  32.2 
 
 		 231 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.490456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4124  nuclease  33.33 
 
 		 260 aa  40  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000792946  hitchhiker  0.000000518116 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2030  nuclease  44.26 
 
 		 238 aa  40  0.01  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.000000000391548 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  33.33 
 
 		 226 aa  40  0.01  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>