99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_2030 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_2030  nuclease  100 
 
 		 238 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.000000000391548 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0608  nuclease  45.11 
 
 		 214 aa  96.7  3e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.780099  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1467  Excalibur domain-containing protein  38.89 
 
 		 259 aa  65.9  0.0000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  38.14 
 
 		 175 aa  63.9  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  38.14 
 
 		 175 aa  63.9  0.000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  39.18 
 
 		 175 aa  64.3  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  39.22 
 
 		 174 aa  62  0.000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2456  nuclease (SNase domain protein)  41.9 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.127297  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1682  nuclease (SNase-like)  40.95 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0199869  normal  0.0644244 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2736  Micrococcal nuclease  36.36 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  33.97 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  34.69 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  32.52 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  35.43 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  31.4 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0873  nuclease (SNase-like)  34.86 
 
 		 178 aa  53.9  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2044  nuclease (SNase-like)  40.98 
 
 		 191 aa  53.9  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04500  nuclease (SNase domain protein)  39.42 
 
 		 276 aa  53.9  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1341  nuclease (SNase domain protein)  39.29 
 
 		 271 aa  52.8  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.223732  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0021  nuclease domain-containing protein  34.53 
 
 		 175 aa  52.8  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0439144  hitchhiker  0.0000334812 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  38.89 
 
 		 166 aa  52.4  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47870  SNase-like protein  34.68 
 
 		 225 aa  52  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0111  nuclease  35.61 
 
 		 227 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0317  nuclease (SNase domain protein)  35.61 
 
 		 227 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183306  normal  0.136686 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  34.62 
 
 		 238 aa  51.6  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1190  nuclease  34.62 
 
 		 166 aa  51.2  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0870678  normal  0.0174729 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  33.33 
 
 		 153 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  33.33 
 
 		 164 aa  50.4  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  33.06 
 
 		 183 aa  50.4  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  33.33 
 
 		 153 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  37.5 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  30.56 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1554  nuclease (SNase-like)  36.28 
 
 		 202 aa  50.4  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19010  nuclease  37.82 
 
 		 167 aa  50.1  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.461402  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0755  nuclease (SNase-like)  34.58 
 
 		 166 aa  49.7  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3683  nuclease  42.31 
 
 		 153 aa  49.3  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0658  nuclease (SNase domain protein)  31.54 
 
 		 171 aa  49.3  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688137  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0065  nuclease  38.74 
 
 		 227 aa  49.3  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0389  nuclease  31.47 
 
 		 183 aa  48.5  0.00009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2046  nuclease (SNase-like)  35.45 
 
 		 233 aa  48.5  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.484882 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  30.21 
 
 		 192 aa  48.1  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1593  nuclease-like protein  43.42 
 
 		 196 aa  48.1  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03631  hypothetical protein  38.17 
 
 		 155 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  37.11 
 
 		 232 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2364  nuclease (SNase domain protein)  35.9 
 
 		 171 aa  47  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000986149  hitchhiker  0.0000256205 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  33.66 
 
 		 185 aa  47.4  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9184  nuclease protein  43.59 
 
 		 127 aa  47.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.779909  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1900  nuclease (SNase-like)  40.22 
 
 		 266 aa  47.8  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.898699  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15970  micrococcal nuclease-like nuclease  32.81 
 
 		 388 aa  46.6  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.339667  normal  0.0582928 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0448  nuclease  30.07 
 
 		 183 aa  46.2  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0938967  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  37 
 
 		 178 aa  46.6  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000025104  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1080  putative nuclease  33.04 
 
 		 168 aa  46.6  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0615  hypothetical protein  35.4 
 
 		 224 aa  46.2  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0516  nuclease  31.47 
 
 		 189 aa  46.2  0.0005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439646  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1306  nuclease (SNase-like)  35.37 
 
 		 175 aa  46.2  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0569  nuclease  30.65 
 
 		 192 aa  45.8  0.0005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2315  nuclease (SNase domain protein)  33.09 
 
 		 185 aa  45.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6085  nuclease  37.27 
 
 		 158 aa  45.8  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2942  prophage MuMc02, nuclease, putative  32.26 
 
 		 216 aa  45.8  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8127  nuclease  33.93 
 
 		 146 aa  45.4  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.129752  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2262  nuclease (SNase-like)  37.17 
 
 		 324 aa  45.4  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.274888  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0199  nuclease  40.24 
 
 		 374 aa  45.4  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.565023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2357  nuclease  30.07 
 
 		 221 aa  45.4  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0133  nuclease  38.46 
 
 		 231 aa  45.4  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.247387 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1969  nuclease (SNase-like)  33.64 
 
 		 172 aa  44.7  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2029  nuclease (SNase-like)  39.81 
 
 		 161 aa  44.7  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0779  nuclease (SNase domain protein)  31.9 
 
 		 169 aa  44.7  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0794  nuclease  43.04 
 
 		 327 aa  44.7  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  37.37 
 
 		 214 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41180  nuclease  37.62 
 
 		 138 aa  43.9  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.804446  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4153  nuclease (SNase domain protein)  34.53 
 
 		 166 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.574783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1472  nuclease  30.07 
 
 		 183 aa  44.3  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  28.16 
 
 		 227 aa  44.3  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1464  micrococcal nuclease  29.91 
 
 		 150 aa  44.3  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1912  nuclease (SNase-like)  36.28 
 
 		 323 aa  44.3  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183465  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0060  nuclease  33.33 
 
 		 351 aa  43.9  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3090  nuclease (SNase-like)  37.08 
 
 		 201 aa  44.3  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.906098  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1274  nuclease  42.03 
 
 		 311 aa  43.1  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1385  thermonuclease  36 
 
 		 190 aa  43.9  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000128794  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1412  thermonuclease  36 
 
 		 190 aa  43.9  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000099778  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2377  SNase-like nuclease  38.53 
 
 		 185 aa  43.1  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0106322  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51840  nuclease  29.51 
 
 		 185 aa  43.1  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4558  nuclease (SNase domain protein)  40.74 
 
 		 179 aa  43.1  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0374  nuclease  35.64 
 
 		 346 aa  43.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.180384  hitchhiker  0.00530121 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4671  nuclease (SNase-like)  42.31 
 
 		 154 aa  43.1  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.91536  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9903  succinoglycan biosynthesis protein  34.26 
 
 		 168 aa  42.7  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3634  nuclease (SNase domain protein)  38.74 
 
 		 382 aa  42.7  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.322659 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2244  nuclease  35.64 
 
 		 534 aa  42.7  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000544674  normal  0.0168792 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1261  nuclease (SNase domain protein)  35.54 
 
 		 301 aa  42.7  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1591  nuclease (SNase-like)  31.93 
 
 		 158 aa  42.4  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4496  nuclease  36.17 
 
 		 187 aa  42.4  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0816  micrococcal nuclease  32.43 
 
 		 228 aa  42.4  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000405887  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0832  micrococcal nuclease  32.43 
 
 		 228 aa  42.4  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000140573  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1433  nuclease  40.85 
 
 		 206 aa  42  0.008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.218416  normal  0.0340527 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1118  nuclease (SNase domain protein)  32.03 
 
 		 180 aa  42  0.008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3956  nuclease (SNase-like)  32.71 
 
 		 171 aa  42  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2245  nuclease (SNase domain protein)  42.86 
 
 		 183 aa  42  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  36.56 
 
 		 162 aa  41.6  0.01  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0594  Excalibur domain-containing protein  29.11 
 
 		 211 aa  41.6  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.187659 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>