13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3328 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3328  hypothetical protein  100 
 
 		 241 aa  478  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.291078 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3627  hypothetical protein  89.21 
 
 		 241 aa  434  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2972  nuclease  33.08 
 
 		 273 aa  115  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1966  putative transmembrane protein  36.68 
 
 		 252 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.113674  normal  0.424222 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9184  nuclease protein  49.55 
 
 		 127 aa  107  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.779909  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8127  nuclease  40.94 
 
 		 146 aa  103  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.129752  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4671  nuclease (SNase-like)  45.61 
 
 		 154 aa  94  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.91536  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4764  nuclease  42.11 
 
 		 196 aa  92.4  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00156339  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0557  nuclease (SNase-like)  42.48 
 
 		 143 aa  84  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.364333  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3090  nuclease (SNase-like)  36.45 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.906098  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0240  nuclease (SNase-like)  33.93 
 
 		 160 aa  57  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0817  nuclease (SNase-like)  32.04 
 
 		 182 aa  50.1  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.113561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3139  nuclease (SNase-like)  31.37 
 
 		 158 aa  48.1  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>