22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3139 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_3139  nuclease (SNase-like)  100 
 
 
158 aa  326  9e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0817  nuclease (SNase-like)  81.53 
 
 
182 aa  262  1e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.113561  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0240  nuclease (SNase-like)  46.21 
 
 
160 aa  115  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8127  nuclease  35.92 
 
 
146 aa  71.2  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.129752  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0557  nuclease (SNase-like)  37.5 
 
 
143 aa  69.7  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.364333  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4671  nuclease (SNase-like)  41.35 
 
 
154 aa  68.9  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.91536  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3090  nuclease (SNase-like)  40.2 
 
 
201 aa  68.6  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.906098  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4764  nuclease  37.86 
 
 
196 aa  65.9  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00156339  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2972  nuclease  27.34 
 
 
273 aa  59.3  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9184  nuclease protein  38.78 
 
 
127 aa  59.3  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.779909  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1966  putative transmembrane protein  34.91 
 
 
252 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.113674  normal  0.424222 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4945  nuclease  31.82 
 
 
170 aa  56.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.377656  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3167  nuclease  35.29 
 
 
122 aa  54.7  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0139898  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1250  nuclease (SNase-like)  35.45 
 
 
124 aa  49.7  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1591  nuclease (SNase-like)  31.53 
 
 
158 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3328  hypothetical protein  31.37 
 
 
241 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.291078 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3964  nuclease  35.05 
 
 
114 aa  47.8  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1554  nuclease (SNase-like)  30.34 
 
 
202 aa  47.4  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3956  nuclease (SNase-like)  28.68 
 
 
171 aa  47  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3627  hypothetical protein  30.39 
 
 
241 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1969  nuclease (SNase-like)  30.97 
 
 
172 aa  44.7  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3319  SNase-like nuclease  34.58 
 
 
158 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.135284 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>