23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3319 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3319  SNase-like nuclease  100 
 
 		 158 aa  320  7e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.135284 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2176  hypothetical protein  55.63 
 
 		 212 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.345086 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2972  nuclease  32.35 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3956  nuclease (SNase-like)  31.54 
 
 		 171 aa  53.1  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1966  putative transmembrane protein  37.37 
 
 		 252 aa  51.2  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.113674  normal  0.424222 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0240  nuclease (SNase-like)  38.32 
 
 		 160 aa  50.4  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3167  nuclease  33.05 
 
 		 122 aa  47.4  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0139898  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  36.19 
 
 		 214 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4671  nuclease (SNase-like)  34.78 
 
 		 154 aa  44.3  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.91536  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1250  nuclease (SNase-like)  32.46 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3090  nuclease (SNase-like)  36 
 
 		 201 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.906098  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1969  nuclease (SNase-like)  32.38 
 
 		 172 aa  43.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  34.58 
 
 		 214 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3139  nuclease (SNase-like)  34.58 
 
 		 158 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0557  nuclease (SNase-like)  34.48 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.364333  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  35.24 
 
 		 226 aa  42.4  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  23.44 
 
 		 175 aa  42  0.004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  22.66 
 
 		 175 aa  41.2  0.005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0816  micrococcal nuclease  28.23 
 
 		 228 aa  41.6  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000405887  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0832  micrococcal nuclease  28.23 
 
 		 228 aa  41.6  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000140573  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  22.66 
 
 		 175 aa  41.2  0.006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  23.48 
 
 		 206 aa  41.2  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0817  nuclease (SNase-like)  34.65 
 
 		 182 aa  40.8  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.113561  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>