63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1250 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1250  nuclease (SNase-like)  100 
 
 		 124 aa  256  1e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3090  nuclease (SNase-like)  43.93 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.906098  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3167  nuclease  41.75 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0139898  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3427  nuclease  37.07 
 
 		 263 aa  58.5  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.983203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4764  nuclease  35.78 
 
 		 196 aa  57.4  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00156339  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2972  nuclease  36.36 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5136  nuclease  38.6 
 
 		 273 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9184  nuclease protein  35.78 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.779909  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0557  nuclease (SNase-like)  36.11 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.364333  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04500  nuclease (SNase domain protein)  37.89 
 
 		 276 aa  53.5  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4671  nuclease (SNase-like)  35.78 
 
 		 154 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.91536  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4959  nuclease  38.05 
 
 		 273 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5086  nuclease (SNase domain protein)  36.84 
 
 		 255 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.715814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0379  nuclease  41.24 
 
 		 273 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1966  putative transmembrane protein  35.78 
 
 		 252 aa  51.2  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.113674  normal  0.424222 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0240  nuclease (SNase-like)  39.45 
 
 		 160 aa  49.7  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3139  nuclease (SNase-like)  35.45 
 
 		 158 aa  49.7  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3323  nuclease  33.98 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.763522 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4945  nuclease  35.29 
 
 		 170 aa  49.7  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.377656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3964  nuclease  34.68 
 
 		 114 aa  50.1  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0817  nuclease (SNase-like)  36.67 
 
 		 182 aa  48.5  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.113561  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5135  staphylococcal nuclease-like protein  34.78 
 
 		 247 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66700  putative nuclease  33.33 
 
 		 255 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8127  nuclease  34.26 
 
 		 146 aa  47.8  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.129752  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0402  nuclease (SNase-like)  32.74 
 
 		 260 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2838  nuclease  33.01 
 
 		 247 aa  47.4  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.426487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0400  nuclease  37.76 
 
 		 267 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.246467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2776  nuclease (SNase-like)  30.89 
 
 		 186 aa  47  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4496  nuclease  35.78 
 
 		 187 aa  46.2  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1084  nuclease (SNase domain protein)  31.63 
 
 		 333 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.598507  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1599  nuclease  34.65 
 
 		 195 aa  46.2  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.798842  normal  0.295978 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1371  nuclease  31 
 
 		 231 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.490456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0371  nuclease  34.95 
 
 		 350 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000121604  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2567  nuclease  33.05 
 
 		 148 aa  45.4  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.190384 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2051  nuclease (SNase-like)  35.85 
 
 		 228 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0268547  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0537  nuclease  32.99 
 
 		 286 aa  45.4  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1554  nuclease (SNase-like)  30.71 
 
 		 202 aa  45.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0538  nuclease  35.4 
 
 		 266 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3956  nuclease (SNase-like)  33.05 
 
 		 171 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  33.91 
 
 		 214 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1969  nuclease (SNase-like)  34.21 
 
 		 172 aa  44.3  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3744  nuclease  32.69 
 
 		 161 aa  44.7  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0848  nuclease-like protein  28.85 
 
 		 184 aa  44.3  0.0006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0898613  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0912  Micrococcal nuclease (thermonuclease)  34.51 
 
 		 190 aa  43.9  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0374  nuclease  32.08 
 
 		 346 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.180384  hitchhiker  0.00530121 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2093  nuclease (SNase domain protein)  32.38 
 
 		 278 aa  43.9  0.0008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00243596  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2244  nuclease  32.08 
 
 		 534 aa  43.5  0.0009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000544674  normal  0.0168792 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1381  micrococcal nuclease-like protein  38.96 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0429202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3319  SNase-like nuclease  32.46 
 
 		 158 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.135284 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1889  nuclease (SNase domain protein)  32.35 
 
 		 224 aa  43.5  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.058729  normal  0.0179002 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2315  nuclease (SNase domain protein)  27.93 
 
 		 185 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5785  putative nuclease  31.58 
 
 		 255 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.397198  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  26.85 
 
 		 185 aa  41.6  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3035  nuclease (SNase-like)  28.3 
 
 		 143 aa  42  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.376528  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0580  nuclease (SNase-like)  29.51 
 
 		 168 aa  41.6  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1359  nuclease (SNase domain protein)  31.86 
 
 		 191 aa  41.6  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104697  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  29.25 
 
 		 192 aa  41.6  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2501  nuclease  30.97 
 
 		 205 aa  40.8  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.080015  normal  0.0413796 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3415  nuclease (SNase-like)  32.14 
 
 		 146 aa  40.8  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1118  nuclease (SNase domain protein)  30.28 
 
 		 180 aa  40.8  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2456  nuclease (SNase domain protein)  30.39 
 
 		 240 aa  40.4  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.127297  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0480  nuclease  31.96 
 
 		 136 aa  40  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.898976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0088  SNase-like nuclease  33.04 
 
 		 192 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.227871 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>