59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3964 on replicon NC_009426
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009426  Saro_3964  nuclease  100 
 
 		 114 aa  228  3e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3167  nuclease  45.1 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0139898  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2501  nuclease  39.32 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.080015  normal  0.0413796 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1359  nuclease (SNase domain protein)  39.32 
 
 		 191 aa  62  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104697  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4945  nuclease  43.43 
 
 		 170 aa  61.2  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.377656  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  37.11 
 
 		 175 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  37.37 
 
 		 175 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4764  nuclease  39 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00156339  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  37.11 
 
 		 175 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2972  nuclease  37.62 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3323  nuclease  40.86 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.763522 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3662  nuclease (SNase domain protein)  38.89 
 
 		 175 aa  53.9  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.808999  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4671  nuclease (SNase-like)  39 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.91536  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1554  nuclease (SNase-like)  33.96 
 
 		 202 aa  53.9  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1969  nuclease (SNase-like)  33.64 
 
 		 172 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3090  nuclease (SNase-like)  38.89 
 
 		 201 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.906098  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3956  nuclease (SNase-like)  34.34 
 
 		 171 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0480  nuclease  42.16 
 
 		 136 aa  51.2  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.898976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2244  nuclease  35.29 
 
 		 534 aa  50.8  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000544674  normal  0.0168792 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1250  nuclease (SNase-like)  34.68 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8127  nuclease  36 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.129752  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  37.72 
 
 		 214 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9184  nuclease protein  38.38 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.779909  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1591  nuclease (SNase-like)  35.35 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0594  Excalibur domain-containing protein  34.55 
 
 		 211 aa  48.5  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.187659 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  31.03 
 
 		 171 aa  48.1  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3139  nuclease (SNase-like)  35.05 
 
 		 158 aa  47.8  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  36.46 
 
 		 212 aa  47  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_004310  BR0870  nuclease domain-containing protein  30.93 
 
 		 189 aa  46.6  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0065  nuclease  35 
 
 		 227 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0862  nuclease domain-containing protein  30.93 
 
 		 189 aa  46.6  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5373  putative nuclease-like protein  34.02 
 
 		 176 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199446 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2776  nuclease (SNase-like)  32.71 
 
 		 186 aa  46.2  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00761  hypothetical protein  31.68 
 
 		 155 aa  46.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.489486 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0240  nuclease (SNase-like)  36.36 
 
 		 160 aa  45.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1682  nuclease (SNase-like)  34.65 
 
 		 153 aa  45.1  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0199869  normal  0.0644244 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06071  micrococcal nuclease  31.73 
 
 		 185 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.312315  normal  0.542138 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4688  nuclease (SNase-like)  29.46 
 
 		 241 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2357  nuclease  29.47 
 
 		 221 aa  44.7  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0859  nuclease (SNase domain protein)  33 
 
 		 243 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0447  nuclease (SNase-like)  30.25 
 
 		 157 aa  44.3  0.0006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0276095  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0317  nuclease (SNase domain protein)  32 
 
 		 227 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183306  normal  0.136686 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1599  nuclease  32.65 
 
 		 195 aa  43.5  0.0009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.798842  normal  0.295978 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0817  nuclease (SNase-like)  32.99 
 
 		 182 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.113561  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4496  nuclease  30.77 
 
 		 187 aa  43.5  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0111  nuclease  31 
 
 		 227 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0537  nuclease  35.29 
 
 		 286 aa  42.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03631  hypothetical protein  36.36 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0791  nuclease (SNase-like)  38.14 
 
 		 169 aa  42  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3744  nuclease  33.02 
 
 		 161 aa  41.6  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5043  nuclease (SNase domain protein)  37.65 
 
 		 249 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3683  nuclease  29.03 
 
 		 153 aa  41.6  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  32 
 
 		 206 aa  41.2  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0290  SNase-like nuclease  30.19 
 
 		 227 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47870  SNase-like protein  31.25 
 
 		 225 aa  40.8  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  27.97 
 
 		 148 aa  40.4  0.008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2576  nuclease (SNase domain protein)  27.84 
 
 		 358 aa  40  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.901293  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0952  nuclease (SNase-like)  34.34 
 
 		 157 aa  40  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1593  nuclease-like protein  35.24 
 
 		 196 aa  40  0.01  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>