53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3415 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3415  nuclease (SNase-like)  100 
 
 		 146 aa  295  1e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0029  nuclease (SNase-like)  45.54 
 
 		 196 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.139234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0154  nuclease  44.44 
 
 		 190 aa  101  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0715  nuclease (SNase-like)  44.17 
 
 		 193 aa  100  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.680905 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0088  SNase-like nuclease  43.36 
 
 		 192 aa  99  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1330  nuclease  45.45 
 
 		 159 aa  97.4  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000142245 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3035  nuclease (SNase-like)  36.81 
 
 		 143 aa  86.3  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.376528  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0033  nuclease (SNase domain protein)  44.25 
 
 		 191 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2567  nuclease  37.58 
 
 		 148 aa  78.6  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.190384 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0580  nuclease (SNase-like)  44.71 
 
 		 168 aa  71.6  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2807  nuclease (SNase-like)  39.66 
 
 		 178 aa  70.1  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00150481  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0873  nuclease (SNase domain protein)  37.61 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.485227 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2354  nuclease (SNase-like)  34.13 
 
 		 164 aa  57  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.527166  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3090  nuclease (SNase-like)  33.33 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.906098  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1025  nuclease  35 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0861238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3167  nuclease  37.38 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0139898  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1218  micrococcal nuclease  36 
 
 		 284 aa  52.4  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340298  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0447  nuclease (SNase-like)  29.58 
 
 		 157 aa  51.2  0.000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0276095  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3956  nuclease (SNase-like)  34.71 
 
 		 171 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0779  nuclease (SNase domain protein)  34.31 
 
 		 169 aa  48.9  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  30.77 
 
 		 153 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2100  nuclease (SNase-like)  34.51 
 
 		 192 aa  47.4  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  28.21 
 
 		 153 aa  47  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1381  micrococcal nuclease-like protein  36.59 
 
 		 88 aa  47  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0429202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1889  nuclease (SNase domain protein)  29.41 
 
 		 224 aa  46.6  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.058729  normal  0.0179002 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1131  nuclease (SNase-like)  35.71 
 
 		 246 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.844533  normal  0.680053 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4496  nuclease  35.07 
 
 		 187 aa  45.1  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  35.58 
 
 		 214 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2776  nuclease (SNase-like)  31.25 
 
 		 186 aa  44.7  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1969  nuclease (SNase-like)  37.17 
 
 		 172 aa  45.1  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0658  nuclease (SNase domain protein)  31.19 
 
 		 171 aa  44.7  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688137  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  29.27 
 
 		 156 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4764  nuclease  29.53 
 
 		 196 aa  43.9  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00156339  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00761  hypothetical protein  33.33 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.489486 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4671  nuclease (SNase-like)  34.21 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.91536  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  32.8 
 
 		 178 aa  43.5  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000025104  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5043  nuclease (SNase domain protein)  40.48 
 
 		 249 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1261  nuclease (SNase domain protein)  36.51 
 
 		 301 aa  42.7  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3707  nuclease (SNase domain protein)  31.82 
 
 		 171 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.112464  normal  0.156975 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1190  nuclease  32.69 
 
 		 166 aa  42.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0870678  normal  0.0174729 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3653  nuclease (SNase domain protein)  31.82 
 
 		 171 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0156  nuclease (SNase-like)  29.1 
 
 		 228 aa  42  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216151  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  24.79 
 
 		 164 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2357  nuclease  30.07 
 
 		 221 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06071  micrococcal nuclease  32.2 
 
 		 185 aa  41.6  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.312315  normal  0.542138 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1554  nuclease (SNase-like)  31.07 
 
 		 202 aa  42  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  29.82 
 
 		 232 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1032  SNase-like nuclease  35.48 
 
 		 246 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  34.29 
 
 		 226 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0240  nuclease (SNase-like)  29.84 
 
 		 160 aa  40.8  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1250  nuclease (SNase-like)  32.14 
 
 		 124 aa  40.8  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0912  Micrococcal nuclease (thermonuclease)  36.89 
 
 		 190 aa  40  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  34.29 
 
 		 214 aa  40  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>