26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0715 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0715  nuclease (SNase-like)  100 
 
 		 193 aa  387  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.680905 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0088  SNase-like nuclease  86.53 
 
 		 192 aa  337  8e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0029  nuclease (SNase-like)  69.19 
 
 		 196 aa  277  7e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.139234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0033  nuclease (SNase domain protein)  78.87 
 
 		 191 aa  261  4e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0154  nuclease  57.14 
 
 		 190 aa  199  3e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3415  nuclease (SNase-like)  44.17 
 
 		 146 aa  100  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1330  nuclease  43.75 
 
 		 159 aa  88.6  5e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000142245 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0580  nuclease (SNase-like)  42.61 
 
 		 168 aa  73.2  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3035  nuclease (SNase-like)  38.33 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.376528  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2567  nuclease  36.52 
 
 		 148 aa  65.5  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.190384 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3090  nuclease (SNase-like)  34.45 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.906098  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0848  nuclease-like protein  33.33 
 
 		 184 aa  51.6  0.000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0898613  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2807  nuclease (SNase-like)  34.62 
 
 		 178 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00150481  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3167  nuclease  39.53 
 
 		 122 aa  50.1  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0139898  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2354  nuclease (SNase-like)  34.26 
 
 		 164 aa  46.2  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.527166  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0447  nuclease (SNase-like)  33.33 
 
 		 157 aa  44.7  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0276095  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03631  hypothetical protein  32.08 
 
 		 155 aa  43.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3744  nuclease  32.11 
 
 		 161 aa  43.5  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1966  putative transmembrane protein  31.58 
 
 		 252 aa  43.1  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.113674  normal  0.424222 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3323  nuclease  38.46 
 
 		 163 aa  42.7  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.763522 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0781  nuclease (SNase-like)  41.33 
 
 		 114 aa  42.4  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0368621  normal  0.0365666 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0658  nuclease (SNase domain protein)  30.91 
 
 		 171 aa  42  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688137  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2357  nuclease  29.73 
 
 		 221 aa  42  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  32.08 
 
 		 164 aa  42  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1554  nuclease (SNase-like)  30.36 
 
 		 202 aa  41.6  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0873  nuclease (SNase domain protein)  33.05 
 
 		 146 aa  41.6  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.485227 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>