34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0029 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0029  nuclease (SNase-like)  100 
 
 		 196 aa  400  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.139234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0088  SNase-like nuclease  70.92 
 
 		 192 aa  279  2e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0715  nuclease (SNase-like)  69.19 
 
 		 193 aa  277  7e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.680905 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0033  nuclease (SNase domain protein)  70.56 
 
 		 191 aa  225  3e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0154  nuclease  60.51 
 
 		 190 aa  209  2e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3415  nuclease (SNase-like)  45.54 
 
 		 146 aa  107  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1330  nuclease  43.75 
 
 		 159 aa  91.7  6e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000142245 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0580  nuclease (SNase-like)  47.31 
 
 		 168 aa  74.3  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2567  nuclease  31.78 
 
 		 148 aa  70.9  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.190384 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3035  nuclease (SNase-like)  37.96 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.376528  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0848  nuclease-like protein  32.69 
 
 		 184 aa  51.6  0.000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0898613  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2807  nuclease (SNase-like)  33.65 
 
 		 178 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00150481  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2354  nuclease (SNase-like)  34.26 
 
 		 164 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.527166  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0658  nuclease (SNase domain protein)  33.33 
 
 		 171 aa  49.3  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688137  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3090  nuclease (SNase-like)  30.7 
 
 		 201 aa  48.9  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.906098  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  35.35 
 
 		 175 aa  48.1  0.00008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  35.35 
 
 		 175 aa  48.1  0.00008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  35.35 
 
 		 175 aa  48.1  0.00009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  30.36 
 
 		 174 aa  47.8  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4945  nuclease  34.51 
 
 		 170 aa  47  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.377656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5043  nuclease (SNase domain protein)  33 
 
 		 249 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  33.93 
 
 		 199 aa  45.1  0.0007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  30.19 
 
 		 185 aa  43.9  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  33.03 
 
 		 166 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3744  nuclease  31.73 
 
 		 161 aa  43.1  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6820  nuclease (SNase domain protein)  34.29 
 
 		 226 aa  43.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0330594  normal  0.398913 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  35.92 
 
 		 214 aa  42.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1554  nuclease (SNase-like)  29.91 
 
 		 202 aa  42.4  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0111  nuclease  35.29 
 
 		 227 aa  42.4  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0317  nuclease (SNase domain protein)  35.29 
 
 		 227 aa  42.7  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183306  normal  0.136686 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1682  nuclease (SNase-like)  32.74 
 
 		 153 aa  42  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0199869  normal  0.0644244 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0065  nuclease  36.54 
 
 		 227 aa  42  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0060  nuclease  32.17 
 
 		 351 aa  42  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1131  nuclease (SNase-like)  37.18 
 
 		 246 aa  41.6  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.844533  normal  0.680053 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>