38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0124 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0124  nuclease (SNase-like)  100 
 
 		 275 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00271835  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2093  nuclease (SNase domain protein)  29.07 
 
 		 278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00243596  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0538  nuclease  28.98 
 
 		 266 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2968  nuclease (SNase domain protein)  25.71 
 
 		 272 aa  95.1  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00021469  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4959  nuclease  25.82 
 
 		 273 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5086  nuclease (SNase domain protein)  25.94 
 
 		 255 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.715814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5785  putative nuclease  24.27 
 
 		 255 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.397198  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66700  putative nuclease  25.1 
 
 		 255 aa  87  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0402  nuclease (SNase-like)  24.9 
 
 		 260 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0379  nuclease  26.36 
 
 		 273 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0400  nuclease  23.9 
 
 		 267 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.246467  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5135  staphylococcal nuclease-like protein  25.12 
 
 		 247 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5136  nuclease  25.52 
 
 		 273 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3775  nuclease  26.43 
 
 		 257 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.770263  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0537  nuclease  29.93 
 
 		 286 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0382  nuclease  29.75 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2838  nuclease  27.54 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.426487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1900  nuclease (SNase-like)  25.21 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.898699  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  30.43 
 
 		 178 aa  60.8  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000025104  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1218  micrococcal nuclease  26.19 
 
 		 284 aa  58.9  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340298  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1412  thermonuclease  30.15 
 
 		 190 aa  58.2  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000099778  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1385  thermonuclease  30.15 
 
 		 190 aa  58.2  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000128794  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04500  nuclease (SNase domain protein)  24.67 
 
 		 276 aa  53.1  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2357  nuclease  20.9 
 
 		 221 aa  50.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  29.5 
 
 		 158 aa  49.7  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1985  nuclease (SNase domain protein)  24.28 
 
 		 193 aa  47  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.242918  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1691  nuclease  25.2 
 
 		 272 aa  47  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0880921 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  28.65 
 
 		 206 aa  47  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1118  nuclease (SNase domain protein)  21.99 
 
 		 180 aa  46.6  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2235  nuclease (SNase domain protein)  23.7 
 
 		 193 aa  46.2  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.197015 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0982  nuclease (SNase-like)  25.88 
 
 		 249 aa  45.8  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000000101814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  24.84 
 
 		 169 aa  45.8  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2244  nuclease  26.21 
 
 		 534 aa  45.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000544674  normal  0.0168792 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  28.92 
 
 		 179 aa  45.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  22.86 
 
 		 183 aa  43.9  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1722  nuclease (SNase domain protein)  22.29 
 
 		 273 aa  42.4  0.008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4688  nuclease (SNase-like)  27.61 
 
 		 241 aa  42.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2044  nuclease (SNase-like)  25.9 
 
 		 191 aa  42.4  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>