30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2380 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_2380  nuclease (SNase domain protein)  100 
 
 		 274 aa  526  1e-148  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00295748  normal  0.102212 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2968  nuclease (SNase domain protein)  31.76 
 
 		 272 aa  84  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00021469  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5785  putative nuclease  32.79 
 
 		 255 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.397198  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66700  putative nuclease  33.2 
 
 		 255 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0402  nuclease (SNase-like)  30.42 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2838  nuclease  24.44 
 
 		 247 aa  65.9  0.0000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.426487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0538  nuclease  31 
 
 		 266 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0382  nuclease  25.1 
 
 		 256 aa  62  0.000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3775  nuclease  26.03 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.770263  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2093  nuclease (SNase domain protein)  27.78 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00243596  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5136  nuclease  29.82 
 
 		 273 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5135  staphylococcal nuclease-like protein  27.83 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4959  nuclease  29.69 
 
 		 273 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5086  nuclease (SNase domain protein)  30.36 
 
 		 255 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.715814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0379  nuclease  28.81 
 
 		 273 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0400  nuclease  30.14 
 
 		 267 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.246467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1900  nuclease (SNase-like)  22.53 
 
 		 266 aa  52.8  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.898699  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0537  nuclease  24.6 
 
 		 286 aa  52  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04500  nuclease (SNase domain protein)  25.98 
 
 		 276 aa  49.7  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  25.14 
 
 		 178 aa  48.9  0.00008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000025104  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3427  nuclease  26.71 
 
 		 263 aa  48.5  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.983203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1218  micrococcal nuclease  27.75 
 
 		 284 aa  46.2  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340298  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1412  thermonuclease  25.17 
 
 		 190 aa  46.2  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000099778  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1385  thermonuclease  25.17 
 
 		 190 aa  46.2  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000128794  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1118  nuclease (SNase domain protein)  34.25 
 
 		 180 aa  44.7  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1889  nuclease (SNase domain protein)  29.37 
 
 		 224 aa  44.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.058729  normal  0.0179002 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0124  nuclease (SNase-like)  23.17 
 
 		 275 aa  44.3  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00271835  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4124  nuclease  23.5 
 
 		 260 aa  43.9  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000792946  hitchhiker  0.000000518116 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0912  Micrococcal nuclease (thermonuclease)  26.21 
 
 		 190 aa  42.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1691  nuclease  28.1 
 
 		 272 aa  42  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0880921 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>