68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0608 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0608  nuclease  100 
 
 		 214 aa  444  1.0000000000000001e-124  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.780099  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0794  nuclease  39.29 
 
 		 327 aa  115  5e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1341  nuclease (SNase domain protein)  34.31 
 
 		 271 aa  105  4e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.223732  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0615  hypothetical protein  38.97 
 
 		 224 aa  92  6e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2030  nuclease  45.11 
 
 		 238 aa  91.3  1e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.000000000391548 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2456  nuclease (SNase domain protein)  29.38 
 
 		 240 aa  77  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.127297  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1455  hypothetical protein  55.17 
 
 		 253 aa  73.6  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.463604  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0844  nuclease  31.91 
 
 		 218 aa  73.2  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0753  nuclease  31 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.838035  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1084  nuclease (SNase domain protein)  27.37 
 
 		 333 aa  65.9  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.598507  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3457  nuclease  28.77 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000805339 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2262  nuclease (SNase-like)  37.61 
 
 		 324 aa  60.5  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.274888  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1912  nuclease (SNase-like)  37.72 
 
 		 323 aa  59.3  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183465  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  26.79 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  28.23 
 
 		 175 aa  59.3  0.00000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1467  Excalibur domain-containing protein  37.89 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3690  copper amine oxidase domain protein  52.08 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  29.03 
 
 		 175 aa  59.3  0.00000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  28.23 
 
 		 175 aa  58.9  0.00000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2051  nuclease (SNase-like)  27.83 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0268547  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0569  nuclease  30.07 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  37.86 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  35.59 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0448  nuclease  30.46 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0938967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1371  nuclease  24.59 
 
 		 231 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.490456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  25.82 
 
 		 232 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1682  nuclease (SNase-like)  38.61 
 
 		 153 aa  53.1  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0199869  normal  0.0644244 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0389  nuclease  29.8 
 
 		 183 aa  52.4  0.000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04500  nuclease (SNase domain protein)  35.35 
 
 		 276 aa  52  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0274  Excalibur domain protein  34.26 
 
 		 443 aa  52  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.611363  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  33 
 
 		 174 aa  51.6  0.000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  32.85 
 
 		 164 aa  51.2  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  38.18 
 
 		 178 aa  50.1  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000025104  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1472  nuclease  28.48 
 
 		 183 aa  49.3  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3789  SNase-like nuclease  30.83 
 
 		 131 aa  48.9  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0300901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1889  nuclease (SNase domain protein)  23.15 
 
 		 224 aa  48.9  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.058729  normal  0.0179002 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0060  nuclease  29.52 
 
 		 351 aa  48.5  0.00007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1412  thermonuclease  33.62 
 
 		 190 aa  48.5  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000099778  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1385  thermonuclease  33.62 
 
 		 190 aa  48.5  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000128794  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2340  nuclease (SNase domain protein)  26.24 
 
 		 162 aa  48.1  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  30 
 
 		 148 aa  47.8  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  24.26 
 
 		 244 aa  47.8  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0324  thermonuclease  30 
 
 		 214 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0658  nuclease (SNase domain protein)  32.04 
 
 		 171 aa  47.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688137  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1433  nuclease  37.23 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.218416  normal  0.0340527 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1274  nuclease  41.03 
 
 		 311 aa  47  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  32.79 
 
 		 156 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0901  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  35.29 
 
 		 254 aa  46.2  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.613801  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  35.05 
 
 		 192 aa  46.2  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15970  micrococcal nuclease-like nuclease  42.86 
 
 		 388 aa  45.1  0.0009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.339667  normal  0.0582928 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0141  thermonuclease family protein  30.19 
 
 		 214 aa  45.1  0.0009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  29.31 
 
 		 153 aa  45.1  0.0009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0272  thermonuclease family protein  30.19 
 
 		 214 aa  45.1  0.0009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  0.843157 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0374  nuclease  38.1 
 
 		 346 aa  44.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.180384  hitchhiker  0.00530121 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0371  nuclease  34.23 
 
 		 350 aa  44.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000121604  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  27.27 
 
 		 185 aa  44.7  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2357  nuclease  29.87 
 
 		 221 aa  44.3  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1900  nuclease (SNase-like)  33.02 
 
 		 266 aa  43.5  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.898699  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2245  nuclease (SNase domain protein)  34.45 
 
 		 183 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0211  thermonuclease family protein  29.09 
 
 		 214 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4945  nuclease  30.77 
 
 		 170 aa  43.1  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.377656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3683  nuclease  31.58 
 
 		 153 aa  43.1  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3427  nuclease  27.21 
 
 		 263 aa  42.7  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.983203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  29 
 
 		 226 aa  42.4  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2942  prophage MuMc02, nuclease, putative  33.7 
 
 		 216 aa  42.4  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0065  nuclease  26.32 
 
 		 227 aa  41.6  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1218  micrococcal nuclease  29.91 
 
 		 284 aa  41.6  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340298  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  24.48 
 
 		 199 aa  41.6  0.01  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>