68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1190 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_2769  Radical SAM domain protein  73.28 
 
 		 595 aa  879    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.847713  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1297  Radical SAM domain protein  74.23 
 
 		 575 aa  889    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3028  Radical SAM domain protein  76.44 
 
 		 572 aa  897    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.377577  normal  0.0472174 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1190  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 590 aa  1198    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.540561  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0640  Radical SAM domain protein  73.3 
 
 		 625 aa  855    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.47984  normal  0.740234 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2101  hypothetical protein  45.41 
 
 		 575 aa  504  1e-141  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.833726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2247  radical SAM family Fe-S protein  44.98 
 
 		 566 aa  491  1e-137  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.747344  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1191  radical SAM domain-containing protein  42.98 
 
 		 551 aa  429  1e-118  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000804505  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1264  radical SAM domain-containing protein  42.39 
 
 		 551 aa  426  1e-118  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2273  radical SAM domain-containing protein  42.98 
 
 		 553 aa  424  1e-117  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.598477  normal  0.253528 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2352  radical SAM domain-containing protein  40.58 
 
 		 565 aa  416  9.999999999999999e-116  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.530094 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1966  Radical SAM domain protein  37.99 
 
 		 556 aa  414  1e-114  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000773606  normal  0.460793 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17240  Radical SAM domain protein  39.9 
 
 		 542 aa  409  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1989  radical SAM domain-containing protein  40.71 
 
 		 565 aa  410  1e-113  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0756  hypothetical protein  41.18 
 
 		 551 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.196935  normal  0.708325 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0614  radical SAM family protein  41.09 
 
 		 557 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0664255 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0148  Radical SAM domain protein  41.65 
 
 		 547 aa  398  1e-109  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0117639 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0677  radical SAM domain-containing protein  37.97 
 
 		 565 aa  397  1e-109  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.866452  normal  0.655818 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2121  radical SAM domain-containing protein  39.26 
 
 		 565 aa  392  1e-108  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1286  Radical SAM domain protein  37.08 
 
 		 532 aa  395  1e-108  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.718238  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0399  radical SAM domain-containing protein  39.79 
 
 		 550 aa  379  1e-104  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.34562  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0927  Radical SAM domain protein  40.98 
 
 		 556 aa  378  1e-103  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.522384  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0475  radical SAM domain-containing protein  41.59 
 
 		 567 aa  368  1e-100  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0716  radical SAM domain-containing protein  39.54 
 
 		 535 aa  364  2e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0774  radical SAM domain-containing protein  38.21 
 
 		 515 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1611  radical SAM domain-containing protein  38.79 
 
 		 510 aa  356  5.999999999999999e-97  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.204247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1438  radical SAM domain-containing protein  36.94 
 
 		 517 aa  353  4e-96  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.328517  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0303  radical SAM domain-containing protein  38.79 
 
 		 510 aa  351  3e-95  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1460  radical SAM domain-containing protein  37.91 
 
 		 509 aa  348  1e-94  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1017  radical SAM domain-containing protein  38.24 
 
 		 510 aa  347  5e-94  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.111265  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1890  radical SAM domain-containing protein  38.96 
 
 		 398 aa  55.8  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1414  MiaB-like tRNA modifying enzyme  25.78 
 
 		 420 aa  52.8  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0522  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.19 
 
 		 420 aa  52  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0311  radical SAM domain-containing protein  35.06 
 
 		 393 aa  52  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2745  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  50 
 
 		 200 aa  52  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000236948  normal  0.898271 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1443  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 410 aa  51.6  0.00004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.664587  normal  0.058788 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1202  radical SAM domain-containing protein  35.9 
 
 		 412 aa  51.6  0.00004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3058  radical SAM domain-containing protein  22.71 
 
 		 529 aa  50.8  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111955  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0018  radical SAM domain-containing protein  27.52 
 
 		 497 aa  50.8  0.00007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2807  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  27.72 
 
 		 485 aa  49.3  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000125377  hitchhiker  0.0000111604 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2962  hypothetical protein  27.27 
 
 		 528 aa  49.7  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.770652  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1228  radical SAM domain-containing protein  35.8 
 
 		 515 aa  48.1  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.641175  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4336  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  32.71 
 
 		 449 aa  48.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.412924 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0391  radical SAM domain-containing protein  40 
 
 		 435 aa  47.8  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4276  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  32.71 
 
 		 449 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1283  Radical SAM domain protein  26.67 
 
 		 451 aa  47.4  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.340157  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1758  DNA uptake protein and related DNA-binding proteins  52.63 
 
 		 110 aa  45.8  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2811  helix-hairpin-helix motif protein  67.74 
 
 		 119 aa  45.8  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0851  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.87 
 
 		 435 aa  45.4  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.154283  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3191  helix-hairpin-helix motif protein  53.85 
 
 		 111 aa  45.1  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.732277 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1061  cobalamin B12-binding  26.34 
 
 		 529 aa  45.1  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000412719  decreased coverage  0.00000367319 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1182  MiaB-like tRNA modifying enzyme  30.21 
 
 		 441 aa  45.1  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0484271  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1536  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  32.29 
 
 		 525 aa  45.1  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0262193 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1715  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  32.29 
 
 		 531 aa  44.7  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0897  Radical SAM domain protein  27.41 
 
 		 564 aa  44.7  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000336813  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0042  radical SAM family protein  22.7 
 
 		 502 aa  44.3  0.006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0642  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  38.57 
 
 		 452 aa  44.3  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0487944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3733  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  32.14 
 
 		 441 aa  43.9  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0655484 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2929  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.99 
 
 		 419 aa  43.9  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.301495 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0639  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  34.09 
 
 		 445 aa  43.9  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.511366 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0470  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  32.14 
 
 		 438 aa  43.9  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2689  radical SAM family protein  23.87 
 
 		 527 aa  43.9  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2762  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.63 
 
 		 420 aa  43.9  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3627  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  39.19 
 
 		 437 aa  43.9  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.109581  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0590  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  32.26 
 
 		 468 aa  43.9  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.632056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2497  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.04 
 
 		 411 aa  43.9  0.009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0715823  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2074  radical SAM binding protein  32.38 
 
 		 598 aa  43.5  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0385557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3120  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  40 
 
 		 443 aa  43.5  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>