33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0303 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0303  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 510 aa  1031    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1611  radical SAM domain-containing protein  94.31 
 
 		 510 aa  979    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.204247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1438  radical SAM domain-containing protein  67.5 
 
 		 517 aa  716    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.328517  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1460  radical SAM domain-containing protein  82.94 
 
 		 509 aa  870    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1017  radical SAM domain-containing protein  95.49 
 
 		 510 aa  987    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.111265  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2101  hypothetical protein  46.17 
 
 		 575 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.833726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2247  radical SAM family Fe-S protein  43.69 
 
 		 566 aa  412  1e-113  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.747344  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1286  Radical SAM domain protein  44.49 
 
 		 532 aa  399  9.999999999999999e-111  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.718238  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0677  radical SAM domain-containing protein  42.8 
 
 		 565 aa  392  1e-108  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.866452  normal  0.655818 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2352  radical SAM domain-containing protein  42.69 
 
 		 565 aa  390  1e-107  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.530094 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2121  radical SAM domain-containing protein  42.69 
 
 		 565 aa  388  1e-106  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1989  radical SAM domain-containing protein  41.94 
 
 		 565 aa  388  1e-106  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1297  Radical SAM domain protein  41.63 
 
 		 575 aa  380  1e-104  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2273  radical SAM domain-containing protein  41.87 
 
 		 553 aa  372  1e-102  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.598477  normal  0.253528 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2769  Radical SAM domain protein  40.15 
 
 		 595 aa  371  1e-101  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.847713  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0756  hypothetical protein  40.43 
 
 		 551 aa  367  1e-100  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.196935  normal  0.708325 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3028  Radical SAM domain protein  40.3 
 
 		 572 aa  367  1e-100  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.377577  normal  0.0472174 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0640  Radical SAM domain protein  38.32 
 
 		 625 aa  360  5e-98  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.47984  normal  0.740234 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1191  radical SAM domain-containing protein  41.49 
 
 		 551 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000804505  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1264  radical SAM domain-containing protein  41.49 
 
 		 551 aa  355  1e-96  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0148  Radical SAM domain protein  41.03 
 
 		 547 aa  354  2.9999999999999997e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0117639 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1190  Radical SAM domain protein  38.79 
 
 		 590 aa  351  2e-95  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.540561  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0399  radical SAM domain-containing protein  41.11 
 
 		 550 aa  340  5e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.34562  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1966  Radical SAM domain protein  39.38 
 
 		 556 aa  337  3.9999999999999995e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000773606  normal  0.460793 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0614  radical SAM family protein  39.58 
 
 		 557 aa  335  9e-91  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0664255 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0475  radical SAM domain-containing protein  39.15 
 
 		 567 aa  330  3e-89  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17240  Radical SAM domain protein  40.12 
 
 		 542 aa  326  5e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0927  Radical SAM domain protein  38.86 
 
 		 556 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.522384  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0716  radical SAM domain-containing protein  39.92 
 
 		 535 aa  314  1.9999999999999998e-84  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0774  radical SAM domain-containing protein  39.73 
 
 		 515 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0558  radical SAM domain-containing protein  23.26 
 
 		 430 aa  52  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.236601  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4090  radical SAM domain-containing protein  24.18 
 
 		 462 aa  48.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0720  Fe-S oxidoreductase  23.78 
 
 		 377 aa  45.8  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>