37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0148 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_2273  radical SAM domain-containing protein  64.71 
 
 		 553 aa  710    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.598477  normal  0.253528 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0756  hypothetical protein  60.44 
 
 		 551 aa  687    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.196935  normal  0.708325 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0399  radical SAM domain-containing protein  61.06 
 
 		 550 aa  676    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.34562  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0148  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 547 aa  1097    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0117639 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0614  radical SAM family protein  57.98 
 
 		 557 aa  631  1e-180  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0664255 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2101  hypothetical protein  49.82 
 
 		 575 aa  499  1e-140  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.833726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2247  radical SAM family Fe-S protein  46.25 
 
 		 566 aa  485  1e-135  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.747344  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1191  radical SAM domain-containing protein  41.5 
 
 		 551 aa  432  1e-120  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000804505  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2769  Radical SAM domain protein  43.99 
 
 		 595 aa  430  1e-119  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.847713  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1297  Radical SAM domain protein  44.22 
 
 		 575 aa  429  1e-119  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0640  Radical SAM domain protein  44.21 
 
 		 625 aa  429  1e-119  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.47984  normal  0.740234 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1264  radical SAM domain-containing protein  41.93 
 
 		 551 aa  427  1e-118  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1966  Radical SAM domain protein  41.68 
 
 		 556 aa  426  1e-118  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000773606  normal  0.460793 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0677  radical SAM domain-containing protein  43.88 
 
 		 565 aa  426  1e-118  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.866452  normal  0.655818 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3028  Radical SAM domain protein  44.65 
 
 		 572 aa  422  1e-117  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.377577  normal  0.0472174 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2121  radical SAM domain-containing protein  44.52 
 
 		 565 aa  424  1e-117  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2352  radical SAM domain-containing protein  44.12 
 
 		 565 aa  417  9.999999999999999e-116  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.530094 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1190  Radical SAM domain protein  41.65 
 
 		 590 aa  416  9.999999999999999e-116  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.540561  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17240  Radical SAM domain protein  40.19 
 
 		 542 aa  403  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0927  Radical SAM domain protein  43.82 
 
 		 556 aa  403  1e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.522384  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1989  radical SAM domain-containing protein  43.17 
 
 		 565 aa  404  1e-111  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1286  Radical SAM domain protein  40.7 
 
 		 532 aa  397  1e-109  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.718238  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0475  radical SAM domain-containing protein  44.25 
 
 		 567 aa  394  1e-108  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0716  radical SAM domain-containing protein  40.8 
 
 		 535 aa  376  1e-103  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0303  radical SAM domain-containing protein  41.73 
 
 		 510 aa  373  1e-102  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1438  radical SAM domain-containing protein  38.88 
 
 		 517 aa  371  1e-101  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.328517  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1460  radical SAM domain-containing protein  40.51 
 
 		 509 aa  371  1e-101  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1611  radical SAM domain-containing protein  41.14 
 
 		 510 aa  369  1e-100  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.204247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1017  radical SAM domain-containing protein  41.34 
 
 		 510 aa  364  2e-99  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.111265  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0774  radical SAM domain-containing protein  37.07 
 
 		 515 aa  356  7.999999999999999e-97  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2409  radical SAM domain-containing protein  27.23 
 
 		 495 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.523158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1890  radical SAM domain-containing protein  23.42 
 
 		 398 aa  52.4  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1202  radical SAM domain-containing protein  24.16 
 
 		 412 aa  48.1  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1283  Radical SAM domain protein  25.56 
 
 		 451 aa  48.1  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.340157  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0311  radical SAM domain-containing protein  24.54 
 
 		 393 aa  46.6  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1443  radical SAM domain-containing protein  23.16 
 
 		 410 aa  45.8  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.664587  normal  0.058788 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1429  Radical SAM domain protein  24.45 
 
 		 497 aa  43.5  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.322628  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>